猪圆环病毒2型河南株全基因组的克隆与遗传进化分析

为了解近几年河南地区猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传进化情况,本研究对采自2011年~2015年河南省13个地区的28份疑似患断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)猪的病料样品进行PCR检测,并将检出的阳性病料样品接种无PCV的PK-15细胞,分离PCV2,进而用IPMA进行鉴定。最后对所获分离株进行全基因组克隆和序列分析。结果显示,28份样品中阳性率为75%(21/28),并成功分离出21株PCV2,其全基因序列同源性为95.4%~99.9%;在遗传演化关系上,21株PCV2分离株分布于两个基因型(PCV2b和PCV2d),16株属于PCV2d,而其余5株属于PCV2b基因型,这也说明PCV2d逐渐成为河南地区的优势流行株。此外,通过对其Cap蛋白氨基酸序列的预测与分析,发现其主要抗原区存在12处位点明显变异,这可能影响其抗原性及免疫原性。本研究为河南地区PCV2的防控提供了依据。