乌鳢感染鰤诺卡氏菌的转录组反应（英文）

利用转录组技术对鰤诺卡氏菌（Nocardia seriolae）感染的乌鳢（Channa argus）进行分析与比较，以揭示可能的免疫机制，尤其在Toll样受体和Nod样受体的免疫反应．从乌鳢的头肾提取总RNA，采用lllumina HiSeqTM2500进行测序和de novo转录组分析．乌鳢感染鰤诺卡氏菌后，对照组和试验组的clean reads分别是33556284（93.79%）和34202766（93.52%）．利用Trinity软件对unigenes进行注释，从133999条unigenes里，一共106319条unigenes得到注释，占79.34%；NR(NCBI non-redundant protein database)注释54886(40.97%)条unigenes;39795(29.69%)的Swiss-Prot注释；5885(4.39%)条unigenes被KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)注释到335条通路；5753条(4.29%)被注释到GO（Gene ontology）里.3912条unigenes表达差异,其中1552条表达上调(39.67%)和2360条表达下调(60.33％).Toll样受体和Nod样受体的免疫信号通路分别有28和13条差别表达基因发现有调制,12和3个上调,11和6个下调,5和4个unigenes没有显著的变化.经过转录组测序分析显示，乌鳢感染鰤诺卡氏菌后的转录复杂程度高，导致感染个体重诱导表达的基因产品的验证发现，尤其在非特异性免疫系统方面．

Northern snakehead Channa argus de novo transcriptomic response to Nocardia seriolae infection