| 全同胞家系中生长差异翘嘴鳜肌肉转录组分析 |
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| 引用本文： | 曾爽,刘宣歌,王鹏飞,胥鹏,曾雷,周磊,唐琴冬,陈挚,李桂峰. 全同胞家系中生长差异翘嘴鳜肌肉转录组分析[J]. 中国水产科学, 2020, 27(1): 53-61 |
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| 作者姓名： | 曾爽 刘宣歌 王鹏飞 胥鹏 曾雷 周磊 唐琴冬 陈挚 李桂峰 |
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| 作者单位： | 中山大学生命科学学院, 水生经济动物研究所, 广东省水生经济动物良种繁育重点实验室, 有害生物控制与资源利用国家重点实验室, 广东 广州 510006 |
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| 基金项目： | 广东省海洋与渔业局项目（A201401A02）；广东省科技厅科技计划项目（2014A020208022）. |
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| 摘 要： | 翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)是中国重要的经济水产养殖品种,对翘嘴鳜基因表达模式进行研究有助于筛选优势个体,培育生长特性优良的品种。为了解体重明显差异翘嘴鳜个体的差异基因表达信息,为翘嘴鳜培育提供基因指导,本研究从同一家系中挑选体重明显差异的3月龄翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)个体进行肌肉转录组测序,研究不同体型个体间基因表达模式差异。结果显示,来自同一家系的翘嘴鳜个体在相同养殖条件下仍出现明显体重差异,养殖3个月后,极大个体(overweight)平均体重可达到极小个体(underweight)的4倍。分别对极大个体和极小个体的肌肉组织进行转录组测序,共获得73353个非重复序列基因(unigenes),通过基因表达量比较共获得8942个差异基因,对差异表达基因进行定义发现,GHR2、IGFR1、4ebp、Mhc、Mlc、Troponin等基因在极小个体中具有更高的表达水平。通过KEGG通路富集显示,蛋白质生成、蛋白质消化、RNA转运通路富集了大量差异表达基因。本研究发现体重差异明显的翘嘴鳜个体具有不同基因表达模式,转录组测序获得了大量差异表达基因信息,为翘嘴鳜生长研究提供了丰富的基因资源。
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| 关 键 词： | 翘嘴鳜；转录组；体重差异；差异表达基因 |
| 修稿时间： | 2020-01-09 |
Muscle transcriptome of Siniperca chuatsi with different weights from a full-sib family |
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| ZENG Shuang,LIU Xuange,WANG Pengfei,XU Peng,ZENG Lei,ZHOU Lei,TANG Qindong,CHEN Zhi,LI Guifeng. Muscle transcriptome of Siniperca chuatsi with different weights from a full-sib family[J]. Journal of Fishery Sciences of China, 2020, 27(1): 53-61 |
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| Authors: | ZENG Shuang LIU Xuange WANG Pengfei XU Peng ZENG Lei ZHOU Lei TANG Qindong CHEN Zhi LI Guifeng |
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| Affiliation: | College of Life Science, Sun Yat-sen University;Institute of Aquatic Economic Animals, Key Laboratory for Aquatic Economic Animals for Breeding and Reproduction, Guangdong Province;State Key Laboratory of Biocontrol, Guangzhou 510006, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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