| 鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列及其毒力特征分析 |
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| 引用本文： | 王超杰,黎洁,王旭,王至诚,王卫民,罗毅. 鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列及其毒力特征分析[J]. 水产学报, 2020, 44(9): 1488-1501 |
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| 作者姓名： | 王超杰 黎洁 王旭 王至诚 王卫民 罗毅 |
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| 作者单位： | 华中农业大学水产学院,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北 武汉 430070;华中农业大学水产学院,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北 武汉 430070;农业微生物学国家重点实验室,湖北 武汉 430070 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31570078) |
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| 摘 要： | 皮特不动杆菌是一种新兴的鱼源致病菌,为了对该菌的致病机理进行研究并为该菌引起的鱼类疾病防治提供技术储备,实验选取皮特不动杆菌菌株Ap-W20进行了全基因组测序,并对其毒力特征进行了分析。结果发现,Ap-W20全基因组序列总长为4 399 705 bp,GC含量为38.78%,共预测到4 230个编码序列(CDS),存在4个质粒,GenBank数据库登录号为CP027658～CP027662。ANI分析结果证实,Ap-W20属于皮特不动杆菌,且ApW20与已知人源皮特不动杆菌AP882(96.69%)和环境源皮特不动杆菌PHEA-2(96.55%)相似度较高。Ap-W20与AP882、PHEA-2的比较基因组学分析发现,Ap-W20中的基因岛、前噬菌体和质粒数量最多,这很可能与它们各自的分离环境和致病力有关。通过与毒力因子数据库(VFDB)比对,在Ap-W20全基因组中预测到286个毒力基因,主要与黏附和抗吞噬等有关。Ap-W20中还存在Ⅰ、Ⅱ和Ⅵ型分泌系统、多套双组分调控系统以及细菌素合成基因簇等,表明鱼源皮特不动杆菌可能存在复杂的致病机制。...
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| 关 键 词： | 皮特不动杆菌 全基因组测序 ANI分析 比较基因组学 毒力特征 |
| 收稿时间： | 2020-02-04 |
| 修稿时间： | 2020-05-02 |
Complete genome sequence of an emerging fish pathogen Acinetobacter pittii strain Ap-W20 and its virulence characteristics |
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| WANG Chaojie,LI Jie,WANG Xu,WANG Zhicheng,WANG Weimin,LUO Yi. Complete genome sequence of an emerging fish pathogen Acinetobacter pittii strain Ap-W20 and its virulence characteristics[J]. Journal of Fisheries of China, 2020, 44(9): 1488-1501 |
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| Authors: | WANG Chaojie LI Jie WANG Xu WANG Zhicheng WANG Weimin LUO Yi |
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| Affiliation: | College of Fisheries, Huazhong Agricultural University, Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Ministry of Education, Wuhan 430070, China; College of Fisheries, Huazhong Agricultural University, Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Ministry of Education, Wuhan 430070, China;State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, Wuhan 430070, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Acinetobacter pittii whole genome sequencing ANI analysis comparative genomics virulence characteristics |
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