| 牛CRP2基因SNPs筛查及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨永强,龚俞,焦仁刚,惠嫣婷,刘若余.牛CRP2基因SNPs筛查及生物信息学分析[J].西南农业学报,2012,25(5). |
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| 作者姓名： | 杨永强 龚俞 焦仁刚 惠嫣婷 刘若余 |
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| 作者单位： | 1. 贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳550025
2. 贵州省畜牧技术推广站,贵州贵阳,550001 |
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| 基金项目： | 贵州省重大科技专项计划项目"牛羊基因定位及标记辅助选择研究" |
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| 摘 要： | 为遗传效应分析及CRP2基因对牛生长调控的功能研究奠定基础,选取生长发育性状差异明显的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CRP2基因第6外显子序列和部分3’-UTR(总长724 bp),切胶回收后对PCR产物进行双向测序,进行不同牛种CRP2基因SNPs筛查.结果表明:在CRP2基因有7个SNPs:T20G,C22G,T151C,T285A,T-157C,G-145A,G-85A,包括3个新的SNP位点(C22G,T-157C,G-85A).CRP2基因第6外显子编码区有2个SNPs,包含1个错义突变(C22G,Gly→Ala)和1个同义突变(T20G)；CRP2基因3’-UTR有2个SNPs(T151C和T285A)；CRP2基因内含子区有3个SNPs,分别为T-157C、G-145A和G-85A.T20G、C22G和T151C位点等位基因频率在不同牛种间有较大差异.突变前后CRP2的RNA二级结构和蛋白质二级结构有明显改变,蛋白质三级结构无明显差异.
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| 关 键 词： | CRP2 DNA池 务川黑牛 贵州荷斯坦奶牛 SNPs |
Screening SNPs and Bioinformatic Analysis of Cattle CRP2 Genes |
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| YANG Yong-qiang
,
GONG Yu
,
JIAO Ren-gang
,
HUI Yan-ting
,
LIU Ruo-yu.Screening SNPs and Bioinformatic Analysis of Cattle CRP2 Genes[J].Southwest China Journal of Agricultural Sciences,2012,25(5). |
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| Authors: | YANG Yong-qiang GONG Yu JIAO Ren-gang HUI Yan-ting LIU Ruo-yu |
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