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草菇菌种退化相关分子标记的筛选
引用本文:李丹青,王 杰. 草菇菌种退化相关分子标记的筛选[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2015, 43(8): 195-201
作者姓名:李丹青  王 杰
作者单位:华南农业大学 食品学院,华南农业大学 食品学院
基金项目:高等学校博士学科点专项科研基金项目(20104404120011)
摘    要:【目的】基于SRAP分子标记技术,筛选出与草菇(Volvariella volvacea)菌丝退化性状紧密连锁的分子标记,为进一步研究目标性状基因的克隆与功能奠定基础。【方法】以草菇正常生长菌株V51(对照)与其菌丝退化菌株(VNM1~10)为材料,采用群体分离分析法分别构建2种草菇的近等基因池。利用SRAP分子标记技术,寻找两类菌株的差异片段,回收差异片段后与pMD-18T载体连接,构建重组质粒pMD-VNMDF并转化E.coli DH5α感受态细胞,将筛选的阳性克隆测序。根据差异片段序列设计引物,将其转化成SCAR分子标记,并对草菇正常菌株V51及其菌丝退化菌株VNM进行扩增试验,验证该标记的真实性和可靠性。【结果】81对SRAP引物组合中有2对引物可扩增出稳定差异条带,其中引物对Me8-Em4PCR扩增出长度约300bp的差异条带(命名为VNMDF)存在于退化菌株中。对SRAP分子标记片段VNMDF回收、测序并进行序列分析发现,该片段长度为279bp,其核酸、氨基酸序列与编码26S蛋白酶体亚基的相似性分别达到81%和93%。利用SCAR特异引物对SCAR250可在菌丝退化菌株中稳定扩增出长度约250bp片段,与预期大小(279bp)一致,而在正常菌株中未扩增出此片段。【结论】获得了1条可能与草菇菌丝退化性状基因紧密连锁的SRAP分子标记,并将其成功转化为SCAR标记(SCAR250)。

关 键 词:草菇;菌种退化;SRAP;SCAR
收稿时间:2014-09-19

Screening of molecular markers associated with degeneration of Volvariella volvacea strains
LI Dan qing,WANG Jie and LI Dan qing,WANG Jie. Screening of molecular markers associated with degeneration of Volvariella volvacea strains[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2015, 43(8): 195-201
Authors:LI Dan qing  WANG Jie  LI Dan qing  WANG Jie
Abstract:
Keywords:Volvariella volvacea  strain degeneration  SRAP  SCAR
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