陕西省榆林地区鸡蛔虫核糖体18S rRNA与ITS-2序列分析及种系发育关系研究

为了探究陕西省榆林地区鸡蛔虫核糖体18S rRNA、ITS-2基因序列特征及其种系发育关系，试验以采集于该地区的28条鸡蛔虫为样品，PCR扩增其18S rRNA、ITS-2基因的部分序列，测序后分别对鸡蛔虫18S rRNA、ITS-2基因序列的碱基组成进行分析，计算A、T、G和C的含量，并对这两个基因的遗传多样性进行分析，比较其种内、种间差异，构建种系发育树。结果表明：测序所获得的鸡蛔虫18S rRNA、ITS-2基因序列的长度分别为637,350 bp;其中18S rRNA基因序列的A、T、G和C的含量分别为24.5%～25.2%、26.1%～26.4%、28.3%～28.7%和20.3%～20.9%,A+T含量为50.6%～51.6%,G+C含量为48.6%～49.6%,种内差异为0～1.6%;与猪蛔虫(MF358962)、人蛔虫(LC422643)、犬弓首蛔虫(FJ418788)及狮弓蛔虫(JF837179)种间差异为5.18%～61.38%;ITS-2基因序列中的A、T、G和C的含量分别为28.9%～29.1%、38.0%～38.6%、19.1%～19.7%与12.9%～13....