| 微生物组-转录组联合分析肠道菌群对SPF鸡的调节作用 |
| |
| 引用本文： | 尹海畅,万德财,王含琼,姚婉岐,李忠秋,刘娣.微生物组-转录组联合分析肠道菌群对SPF鸡的调节作用[J].黑龙江畜牧兽医,2023(15):57-63+134-135. |
| |
| 作者姓名： | 尹海畅 万德财 王含琼 姚婉岐 李忠秋 刘娣 |
| |
| 作者单位： | 1. 黑龙江省农业科学院2021年博士后科研工作站;2. 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院;3. 东北农业大学动物科学技术学院 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32202800)；;黑龙江省自然科学基金联合引导项目(LH2022C104)； |
| |
| 摘 要： | 为了探究肠道菌群对SPF鸡的作用，试验采用广谱抗生素(ABX)鸡尾酒法构建肠道菌群削减SPF鸡模型(ABX鸡),并以SPF鸡为对照，应用微生物组测序技术分析鸡肠道菌群变化情况，转录组测序技术分析鸡回肠和气管差异基因表达情况，同时评估肠道菌群对鸡体重和Ⅰ型干扰素(IFN-Ⅰ)表达的影响，并通过计算Spearman相关系数分析肠道微生物组变化与SPF鸡转录组变化之间的功能相关性。结果表明：与SPF鸡相比，ABX鸡肠道菌群的物种多样性和丰度明显降低；从ABX鸡肠组织共获得156个差异表达基因，其中79个基因上调表达，77个基因下调表达；从气管组织共获得779个差异表达基因，其中176个基因上调表达，603个基因下调表达。气管组织共比对到3 152个GO功能条目，回肠组织共对比到1 202个GO功能条目。气管组织转录组显著富集的KEGG信号通路分别为补体和凝血级联、金黄色葡萄球菌感染、类风湿关节炎、自身免疫性甲状腺疾病，回肠组织转录组显著富集的KEGG信号通路分别为Ⅰ型糖尿病、类固醇生物合成、移植物抗宿主病、同种异体排斥等。从广谱抗生素处理的第11天开始，ABX鸡和SPF鸡的体重差异显著(P&...
|
| 关 键 词： | 肠道菌群 微生物组 转录组 体重 免疫 |
|
|
