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桔梗RAPD-PCR体系的正交优化及引物筛选
引用本文:夏晓娟,王 丽,魏建和. 桔梗RAPD-PCR体系的正交优化及引物筛选[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2008, 36(10): 193-198
作者姓名:夏晓娟  王 丽  魏建和
作者单位:[1]四川大学生命科学学院。四川成都610064 [2]中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所,北京100094
基金项目:国家科技攻关计划,国家中药材扶持项目,北京市科技新星计划项目
摘    要:【目的】建立桔梗RAPD-PCR反应的最佳体系并应用于桔梗遗传图谱的构建。【方法】以2个桔梗亲本GS16和GS106的叶片DNA为模板,对桔梗DNA的提取及对影响桔梗RAPD-PCR扩增的重要参数进行优化试验,并从530个随机引物中筛选出在2个亲本间具多态性的引物。【结果】叶片研磨后用蒸馏水预洗及2次沉淀时加入3 mol/L NaCl(pH 5.2)溶液,提取的基因组DNA纯度较高。优化的最佳反应体系总体积为25μL,内含ddH2O12.4μL、10×buffer 2.5μL、引物0.3μmol/L、dNTPs 200μmol/L、Mg2+2.5 mmol/L、TaqDNA聚合酶0.5 U、DNA模板40 ng;反应程序为:94℃预变性4 min;94℃30 s,35.3℃1 min,72℃2 min,40次循环;72℃10 min。按此优化RAPD条件成功地从530个随机引物中筛选出了115个在两亲本间具多态性的引物。【结论】改良的CTAB法能成功用于桔梗基因组DNA提取,建立的最佳反应体系可用于桔梗遗传图谱的构建。

关 键 词:桔梗  RAPD  体系优化  正交设计  引物筛选
收稿时间:2007-11-05

The optimization of RAPD-PCR system with orthogonal design and primers screening in Platycodon grandiflorum
XIA Xiao-juan,WANG Li,WEI Jian-he,YANG Cheng-min,CHU Qing-long,YU Jing. The optimization of RAPD-PCR system with orthogonal design and primers screening in Platycodon grandiflorum[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2008, 36(10): 193-198
Authors:XIA Xiao-juan  WANG Li  WEI Jian-he  YANG Cheng-min  CHU Qing-long  YU Jing
Affiliation:1 College of Life Sciences,Sichuan University,Chengdu,Sichuan 610064,China;2 Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College,Beijing 100094,China)
Abstract:
Keywords:RAPD
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