| 中国南海野生斑节对虾5个地理群体线粒体16S rRNA基因序列比较分析 |
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| 引用本文： | 周发林,江世贵,姜永杰,黄建华,马之明.中国南海野生斑节对虾5个地理群体线粒体16S rRNA基因序列比较分析[J].水产学报,2009,33(2):208-214. |
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| 作者姓名： | 周发林 江世贵 姜永杰 黄建华 马之明 |
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| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306
2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，广东省科技计划项目，农业结构调整项目 |
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| 摘 要： | 对中国南海海域5个斑节对虾野生群体三亚群体(SY)、深圳群体(SZ)、阳江群体(YJ)、湛江群体(ZJ)、北海群体(BH)100个样品的16S rRNA 序列进行PCR扩增,并对扩增产物进行了测序.用CLUSTAL_X排序软件对测序所得的100个16S rRNA序列进行比对.通过ARLEQUIN软件对所得100个16S rRNA序列进行比较分析,共检测出28个变异位点,19种单倍型.三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的核苷酸多样性(π)依次分别为0.004 35,0.005 86,0.010 50,0.010 81,0.011 68.三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的单倍型多样性(H)依次分别为0.689 5, 0.521 1, 0.573 7, 0.600 0, 0.721 1.对5个野生群体的16S rRNA序列进行FST分析,结果表明湛江、北海群体分别与三亚、深圳两个群体有显著的遗传差异,其余群体之间的遗传差异不显著.对5个群体进行AMOVA分析结果表明,5个群体间存在显著性遗传差异.对5个群体构建分子系统树,结果表明,三亚和深圳群体之间的亲缘关系最近;北海、湛江群体与三亚、深圳群体的亲缘关系很远.实验表明,中国南海海域5个斑节对虾野生群体可以为斑节对虾的选择育种提供两个基础群体:一个是三亚、深圳野生原种基础群体;另一个是湛江和北海野生原种基础群体.
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| 关 键 词： | 斑节对虾 遗传多样性 中国南海 |
| 收稿时间： | 2007/12/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2008/4/28 0:00:00 |
Assessing genetic diversity of the five wild tiger prawn (Penaeus monodon) populations in the coastal waters of South China Sea, based on mitochondrial DNA 16S rRNA sequences |
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| ZHOU Fa-lin,JIANG Shi-gui,JIANG Yong-jie,HUANG Jian-hua,MA Zhi-ming.Assessing genetic diversity of the five wild tiger prawn (Penaeus monodon) populations in the coastal waters of South China Sea, based on mitochondrial DNA 16S rRNA sequences[J].Journal of Fisheries of China,2009,33(2):208-214. |
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| Authors: | ZHOU Fa-lin JIANG Shi-gui JIANG Yong-jie HUANG Jian-hua MA Zhi-ming |
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| Institution: | South China Sea Fisheries Research Institute,,,, |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | 16SrRNA |
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