苎麻纤维素合成酶基因BnCesA4 cDNA序列的克隆与表达分析 |
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作者姓名: | 刘昱翔, 陈建荣, 彭彦, 黄妤, 赵燕, 黄丽华, 郭清泉, 张学文 |
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作者单位: | [1]湖南农业大学生物科学技术学院,长沙410128; [2]长沙学院生物工程与环境科学系,湖南长沙410003 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31071457);湖南省科技计划重点项目(2012NK3062);湖南省教育厅项目(SCX1103);湖南省教育厅科学研究一般项目(12C0156). |
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摘 要: | 利用本地BLAST工具,从先期获得的苎麻转录组数据中发掘出与多种植物纤维素合成酶基因有较高同源性的序列CL6473.以苎麻(Boehmeria nivea)栽培种湘苎3号为材料,根据CL6473设计引物,先采用PCR扩增克隆了苎麻一个纤维素合成酶基因cDNA的核心片段,再运用5′及3′RACE获得该基因全长cDNA,序列分析表明该cDNA为一个新的苎麻纤维素合成酶基因cDNA,命名为BnCesA4.BnCesA4cDNA序列全长4008bp,其中编码区全长3270bp,编码一个含1090aa的多肽,具有植物纤维素酶的保守结构域及特征氨基酸序列.根据该cDNA高可变区序列设计其特异性引物,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对BnCesA4基因在几个代表性苎麻品种:湘苎3号、湘苎1号、湘潭大叶白及城步青麻的木质部和韧皮部两种组织中的表达情况进行了定量分析.qRT-PCR显示BnCesA4基因在不同品种苎麻的木质部及韧皮部均有表达,表达量差异不大.
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关 键 词: | 苎麻 纤维素合成酶基因 克隆 定量表达分析 |
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