| 杜兰落花生球蛋白基因家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈湘瑜,徐日荣,陈 昊,唐兆秀.杜兰落花生球蛋白基因家族的生物信息学分析[J].中国油料作物学报,2019,41(3):391-398. |
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| 作者姓名： | 陈湘瑜 徐日荣 陈 昊 唐兆秀 |
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| 作者单位： | 福建省农业科学院作物研究所，福建福州，３５００１３ |
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| 基金项目： | 福建省属公益类科研院所基本科研专项（２０１７Ｒ１０２６－７）；福建省农业科学院科技创新团队项目（ＳＴＩＴ２０１７－２－６）；福建省农业科
学院一般性引导项目（ＡＣ２０１７２０） |
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| 摘 要： | 为了解球蛋白基因家族在杜兰落花生(Arachis duranensis)种子中的特征,利用生物信息学方法对杜兰落花生球蛋白基因进行全基因组鉴定及表达模式分析。结果表明,杜兰落花生含有9个球蛋白基因,家族成员间理化特性总体差异不大,亲缘关系相近的蛋白具有相似的保守基序组成。根据物种间的球蛋白系统进化树,球蛋白进化关系符合物种之间的亲缘关系。杜兰落花生球蛋白在进化过程中较为保守,受纯化选择主导,但在部分进化枝上存在正选择位点。栽培种花生转录组数据分析表明,15个花生球蛋白基因在花生种子中检测到表达,其中4个表达量远超其它成员,在花生荚果成熟后期表达量仍较高。
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| 关 键 词： | 杜兰落花生 球蛋白基因家族 生物信息 系统发育 选择压力 表达模式 |
Bioinformatic analysis of globulin gene family in Arachis duranensis |
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| CHEN Xiang-yu,XU Ri-rong,CHEN Hao,TANG Zhao-xiu.Bioinformatic analysis of globulin gene family in Arachis duranensis[J].Chinese Journal of Oil Crop Sciences,2019,41(3):391-398. |
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| Authors: | CHEN Xiang-yu XU Ri-rong CHEN Hao TANG Zhao-xiu |
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| Institution: | Crop Research Institute of Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Arachis duranensis Globulin gene family bioinformation phylogenetic selective pressure expression pattern |
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