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基于线粒体基因标记的太平洋褶柔鱼群体遗传结构及变异分析
引用本文:张琴,曹洋铭,陆化杰,刘洋,张忠,方舟,王丛丛.基于线粒体基因标记的太平洋褶柔鱼群体遗传结构及变异分析[J].上海海洋大学学报,2021,30(4):763-769.
作者姓名:张琴  曹洋铭  陆化杰  刘洋  张忠  方舟  王丛丛
作者单位:上海海洋大学,上海海洋大学
基金项目:国家重点研发计划、国家自然科学基金、大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室开放基金项目
摘    要:为科学管理和开发利用太平洋褶柔鱼(Todarodes pacificus)渔业资源,该研究利用线粒体DNA(mtDNA)细胞色素C氧化酶I(CO I)和细胞色素b(Cytb)两种标记基因对西北太平洋褶柔鱼进行群体遗传结构和变异分析。结果显示:得到太平洋褶柔鱼两种基因片段的序列长度分别为465 bp(CO I)和404 bp(Cytb),分别定义了18和21个单倍型,总体呈现低单倍型多样性(h=0.493、0.479)和低核苷酸多样性(π=0.0013、0.0014);遗传分化系数(Fst)值均为负值,而分子生物学方差(AMOVA)分析结果表明该群体变异都来源于种内;太平洋褶柔鱼CO I基因序列的Tajima’s D和Fu’s Fs的中性检验D值和Fs值显著偏离0,且二者显著性检验P<0.01,与Cytb基因标记的群体结果相似。综上,位于东海和日本海海域的太平洋褶柔鱼种群遗传多样性较低,群体间基因交流频繁未出现遗传分化,且变异基本来源于种内,群体大约在1.2万-1.5万年前出现过种群扩张。故建议将太平洋褶柔鱼划分为一个管理单元,以便该渔业资源更加合理的保护与开发利用。

关 键 词:太平洋褶柔鱼  遗传变异  细胞色素C氧化酶I  细胞色素b
收稿时间:2020/7/8 0:00:00
修稿时间:2020/9/15 0:00:00

Genetic variation and genetic structure analysis of Todarodes pacificus based on mitochondrial DNA markers
ZHANG Qin,CAO Yangming,LU Huajie,LIU Yang,ZHANG Zhong,FANG Zhou,WANG Congcong.Genetic variation and genetic structure analysis of Todarodes pacificus based on mitochondrial DNA markers[J].Journal of Shanghai Ocean University,2021,30(4):763-769.
Authors:ZHANG Qin  CAO Yangming  LU Huajie  LIU Yang  ZHANG Zhong  FANG Zhou  WANG Congcong
Institution:Shanghai Ocean University,Shanghai Ocean University
Abstract:
Keywords:Todarodes pacificus  genetic variation  Cytochrome C oxidase I  Cytochrome b
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