| 龙眼胚性愈伤组织RNA结合蛋白LSm14的基因克隆、亚细胞定位及表达分析 |
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| 引用本文： | 厉雪,苏立遥,陈燕,张舒婷,徐小萍,陈晓慧,陈荣珠,赖钟雄,林玉玲.龙眼胚性愈伤组织RNA结合蛋白LSm14的基因克隆、亚细胞定位及表达分析[J].果树学报,2020(6):808-818. |
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| 作者姓名： | 厉雪 苏立遥 陈燕 张舒婷 徐小萍 陈晓慧 陈荣珠 赖钟雄 林玉玲 |
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| 作者单位： | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31672127);福建省高原学科建设经费(102/71201801101);福建农林大学创新基金(CXZX2017187,CXZX2018078)。 |
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| 摘 要： | 【目的】探究LSm14对龙眼体胚发生的影响,克隆RNA结合蛋白DlLSm14e基因并观察其亚细胞定位,分析其表达特性。【方法】以龙眼胚性愈伤组织为材料,依据转录组数据和基因组数据,采用RT-PCR克隆了一个DlLSm14基因,将其命名为DlLSm14e。对该基因进行生物信息学分析、亚细胞定位观察、龙眼非胚性愈伤组织和不同胚性培养物以及不同激素处理下的FPKM值分析和不同浓度细胞分裂素(KT)处理下的qRT-PCR检测。【结果】该基因CDS全长1707 bp,编码568个氨基酸,该蛋白不含信号肽和跨膜结构,不属于分泌蛋白和跨膜蛋白;此外,该蛋白含有N端保守结构域以及延长的C端,并且含有74个磷酸化修饰位点;系统发育分析表明,DlLSm14e蛋白与漾濞槭(Acer yangbiense)相似度较高,与单子叶植物亲缘关系最远;顺式作用元件分析表明,该基因含有大量光响应元件和多种激素响应元件;亚细胞定位结果表明,该基因为核定位基因;表达谱与实时荧光定量分析显示,DlLSm14e的FPKM值在非胚性愈伤组织(NEC)阶段最低,在球形胚阶段达到最高,推测DlLSm14e大量累积可能有利于龙眼体胚早期形态建成;不同激素处理下,2,4-D抑制该基因表达,KT促进其表达,而KT的浓度能影响该基因的表达。【结论】龙眼LSm14e基因定位于细胞核,该基因FPKM值随龙眼体胚胚性增加而升高,并且响应多种与龙眼体胚发生相关的激素,推测该基因可能参与龙眼体胚早期的形态建成。
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| 关 键 词： | 龙眼 DlLSm14基因 克隆 亚细胞定位 表达 |
Cloning,subcellular localization and expression analysis of RNA binding protein LSm14 gene from embryogenic calli of Dimocarpus longan Lour. |
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| LI Xue,SU Liyao,CHEN Yan,ZHANG Shuting,XU Xiaoping,CHEN Xiaohui,CHEN Rongzhu,LAI Zhongxiong,LIN Yuling.Cloning,subcellular localization and expression analysis of RNA binding protein LSm14 gene from embryogenic calli of Dimocarpus longan Lour.[J].Journal of Fruit Science,2020(6):808-818. |
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| Authors: | LI Xue SU Liyao CHEN Yan ZHANG Shuting XU Xiaoping CHEN Xiaohui CHEN Rongzhu LAI Zhongxiong LIN Yuling |
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| Institution: | (Institute of Horticultural Biotechnology,Fujian Agricultural and Forestry University,Fuzhou 350002,Fujian,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dimocarpus longan DlLSm14 gene Cloning Subcellular localization Expression |
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