| 2006—2007年陕西省古典猪瘟流行毒株E0基因的克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 吴旭锦,朱小甫,陈德坤. 2006—2007年陕西省古典猪瘟流行毒株E0基因的克隆及序列分析[J]. 浙江大学学报(农业与生命科学版), 2010, 36(1): 16. DOI: 10.3785/j.issn.1008-9209.2010.01.003 |
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| 作者姓名： | 吴旭锦 朱小甫 陈德坤 |
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| 作者单位： | 1. 咸阳职业技术学院,生物科技系,陕西,咸阳712000
2. 西北农林科技大学,动物医学院,陕西,杨凌,712100 |
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| 摘 要： | 根据GenBank上发表的古典猪瘟参考毒株Shi men毒株全基因组序列,设计并合成2对引物,采用巢式RT-PCR技术,从陕西省猪病料中成功扩增出9株猪瘟流行毒株E0全基因并测定其核苷酸序列,与已发表的ALD、Alfort187、Brescia、C HVRI、CAP、Shi men、GXWZ02和HCLV等代表毒株进行同源性比较分析。核苷酸分析表明:这9株猪瘟流行毒株可以分为2大群,1株(LN163)属于群I,与Shi men强毒株、HCLV疫苗株和GXWZ02野毒株等代表株的同源性为80.8%~82.4%;另外8株属于群II,毒株之间E0基因核苷酸序列的同源性为93.6%~99.6%。氨基酸序列分析表明:9株流行毒株中,群I中的LN163毒株与我国野毒参照株GXWZ02的同源性只有83.9%,而其余8株与GXWZ02株氨基酸序列的同源性为94.4%~98.1%,形成明显不同的进化分支;同时这9株流行毒株与我国疫苗株HCLV和经典强毒株Shi men的氨基酸序列同源性分别为88.0%~89.5%和89.1%~91.8%,均呈现较明显的变异。
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| 关 键 词： | 古典猪瘟 E0基因 克隆 序列分析 |
Cloning and sequence analysis of E0 gene of virulent classical swine fever virus isolates in Shaanxi Province in 2006-2007 |
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| WU Xu-jin,ZHU Xiao-fu,CHEN De-kun. Cloning and sequence analysis of E0 gene of virulent classical swine fever virus isolates in Shaanxi Province in 2006-2007[J]. Journal of Zhejiang University(Agriculture & Life Sciences), 2010, 36(1): 16. DOI: 10.3785/j.issn.1008-9209.2010.01.003 |
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| Authors: | WU Xu-jin ZHU Xiao-fu CHEN De-kun |
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| Affiliation: | WU Xu-jin1,ZHU Xiao-fu1,CHEN De-kun2 (1.Department of Biology Science & Technology,Xianyang Vocational Technical College,Xianyang,Shaanxi 712000,China,2.College of Veterinary Medicine,Northwest A & F University,Yangling,Shaanxi 712100,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | classical swine fever E0 gene cloning sequence analysis |
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