| 小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 黄春丽,宋静,李全权,郭庆东,田秋菊,高居荣,王洪刚,封德顺. 小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析[J]. 山东农业科学, 2015, 0(7) |
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| 作者姓名： | 黄春丽 宋静 李全权 郭庆东 田秋菊 高居荣 王洪刚 封德顺 |
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| 作者单位： | 山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,271018 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31171552)；转基因生物新品种培育科技重大专项(2013ZX08002-003)；山东小麦玉米周年高产高效生产协同创新中心项目 |
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| 摘 要： | 本研究运用Gene Fishing技术,从经过PEG-6000模拟干旱处理的小偃麦异附加系种质SN6306的c DNA中获得了一个长度为586 bp的上调表达差异片段7154。通过NCBI数据库相似性比对,预测其为木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶基因(XTH)的一段序列。经克隆和RT-PCR获得Ta XTH的全长c DNA和DNA序列,对其核酸和蛋白序列分析的结果表明,Ta XTH全长DNA序列为2 224 bp,含有3个外显子和2个内含子;其开放阅读框(ORF)长度为936 bp,编码311个氨基酸。Blast P分析结果显示,Ta XTH属于GH16蛋白家族。相似性比对分析结果表明,该蛋白与小麦近缘物种二穗短柄草中的同源蛋白一致性达到79%。从多序列联配及系统进化树分析结果中推断Ta XTH属于XTH类,具有典型的DEIDFEFLG保守基序。
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| 关 键 词： | 小偃麦异附加系 TaXTH 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of TaXTH from Wheat -Thinopyrum Alien Addition Line |
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| Huang Chunli,Song Jing,Li Quanquan,Guo Qingdong,Tian Qiuju,Gao Jurong,Wang Honggang,Feng Deshun. Cloning and Bioinformatics Analysis of TaXTH from Wheat -Thinopyrum Alien Addition Line[J]. Shandong Agricultural Sciences, 2015, 0(7) |
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| Authors: | Huang Chunli Song Jing Li Quanquan Guo Qingdong Tian Qiuju Gao Jurong Wang Honggang Feng Deshun |
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| Keywords: | Wheat -Thinopyrum alien addition line TaXTH Gene clone Bioinformatics analysis |
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