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獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究
引用本文:郝晔,施丽娟,闫晓荣,赵博昊,朱杰,陈阳,翁巧琴,吴信生.獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究[J].安徽农业科学,2016(9).
作者姓名:郝晔  施丽娟  闫晓荣  赵博昊  朱杰  陈阳  翁巧琴  吴信生
作者单位:扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009;江苏省动物繁育与分子设计重点实验室,江苏扬州225009;浙江省余姚市欣农兔业有限公司,浙江余姚,315400
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项(CARS-44-1),江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD 2014-134)
摘    要:目的]探索獭兔酪氨酸相关蛋白1(Tyrp1)基因在毛色形成过程中的分子机制。方法]对獭兔Tyrp1基因序列的核苷酸序列、编码产物的基本理化性质等进行预测和分析,同时利用PCR-SSCP(Single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products)技术检测Tyrp1基因CDS序列的多态性分布状况。结果]信息学分析发现,TYRP1蛋白是不稳定的亲水性蛋白,有信号肽,具有酪氨酸酶家族特征性功能结构域。多态性检测发现仅在Tyrp1基因CDS的483 bp处存在1个C→T的同义突变,位于外显子2上,该碱基的突变没有造成氨基酸的改变(AUC→AUT,异亮氨酸)。Hardy-Weinberg平衡检验表明,青紫蓝色獭兔群体处于非平衡状态,白色獭兔群体处于平衡状态。青紫蓝兔群体为中度多态信息含量(0.25PIC0.50),白色獭兔群体为低度多态信息含量(PIC0.25)。结论]Tyrp1基因对獭兔的毛色有一定的影响。该研究结果可为獭兔毛色的选种选育提供一定的参考。

关 键 词:獭兔  Tyrp1  SNPs  序列分析

Analysis of Polymorphism of Exons in Tyrosinase-Related Protein 1 (Tyrp1) Gene in Rex Rabbit(Oryctolagus cuniculus)
Abstract:
Keywords:Rex rabbit  Tyrp1  SNPs  Sequence analysis
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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