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鸡下丘脑高丰度差异性表达let-7a的组织表达谱及其功能分析
引用本文:王乐乐,李国喜,康相涛,张锁,孙桂荣. 鸡下丘脑高丰度差异性表达let-7a的组织表达谱及其功能分析[J]. 农业生物技术学报, 2013, 21(3)
作者姓名:王乐乐  李国喜  康相涛  张锁  孙桂荣
作者单位:1. 河南农业大学牧医工程学院,郑州,450002
2. 河南农业大学牧医工程学院,郑州450002;河南省家禽种质资源创新工程研究中心,郑州450002
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项
摘    要:前期对固始鸡1日龄和36周龄下丘脑miRNA的Solexa测序分析表明,let-7a为鸡(Gallus domesticus)下丘脑发育过程高丰度差异性表达miRNA.为全面了解鸡let-7a的功能,采用实时定量PCR检测了1日龄和36周龄固始鸡两个发育阶段13种组织中let-7a的表达情况.结果表明:let-7a在所检测的组织中呈广泛性表达,其在下丘脑中的表达趋势与高通量测序结果一致;1日龄时,let-7a在下丘脑和肾脏中高丰度表达,在肺中低丰度表达,其他组织中适度表达;36周龄时,let-7a在各组织中的表达量都较低,除了在肺中的表达量较1日龄上升外,其余各组织的表达量都下降.同时,采用两种算法预测了let-7a的靶基因,并对107个共有靶基因进行了基因本体功能(Go)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,结果显示:靶基因主要在生物学过程调节相关的生物学过程中富集,尤其是与矿物质和磷代谢相关的调节过程;且在粘着斑、细胞外基质受体互作、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等3个通路中显著富集(P<0.01).这些结果为进一步研究let-7a功能提供了有益线索.

关 键 词:  let-7a  组织表达谱  功能预测

Tissue Expression Profile and Function Analysis of Abundance and Differential Expression Let-7a from Chicken(Gallus domesticus) Hypothalamus
WANG Le-Le , LI Guo-Xi , KANG Xiang-Tao , ZHANG Suo , SUN Gui-Rong. Tissue Expression Profile and Function Analysis of Abundance and Differential Expression Let-7a from Chicken(Gallus domesticus) Hypothalamus[J]. Journal of Agricultural Biotechnology, 2013, 21(3)
Authors:WANG Le-Le    LI Guo-Xi    KANG Xiang-Tao    ZHANG Suo    SUN Gui-Rong
Abstract:
Keywords:
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