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郏县红牛跨膜蛋白18基因(TMEM18)SNPs检测及其与生长性状的关联分析
引用本文:马伟,马云,刘栋,高远,王居强,陈宏. 郏县红牛跨膜蛋白18基因(TMEM18)SNPs检测及其与生长性状的关联分析[J]. 农业生物技术学报, 2013, 21(2)
作者姓名:马伟  马云  刘栋  高远  王居强  陈宏
作者单位:1. 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100
2. 信阳师范学院生命科学学院,信阳,464000
3. 河南省肉牛工程技术研究中心,郑州,450003
基金项目:国家转基因重大专项,农业部现代肉牛产业技术体系专项,国家自然科学基金,陕西省农业科技创新项目,河南省高校科技创新人才项目
摘    要:跨膜蛋白18基因(Transmembrane protein 18,TMEM18)在神经系统表达.全基因组关联分析(GWAS)表明,该基因的突变会影响人类肥胖和Body Mass Index(BMI)值变化.本研究采用DNA池测序技术检测了郏县红牛(Bos taurus) TMEM18基因5个外显子和部分内含子区单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,通过PCR-RFLP技术对所发现的SNP位点进行分型验证,然后分析不同基因型与郏县红牛生长性状的关联性.结果表明,在郏县红牛TMEM18基因上共发现了3处新的SNPs:NW_003099175.1∶g.2303G>A、g.3835 G>A和g.3865 A>G(aa.Gly>Ser).关联分析结果表明,郏县红牛TMEM18基因g.2303G>A位点AA型个体体高、体长、胸围和体重显著大于GG型(P<0.05),郏县红牛TMEM18基因g.3835 G>A位点AG型个体胸围和体重显著大于AA型(P<0.05).研究结果提示,这两个位点可作为郏县红牛品种体尺和体重生长性状选择的分子育种候选标记.

关 键 词:  TMEM18基因  SNP  生长性状

SNPs Detection of Transmembrane Protein 18 Gene (TMEM18) and Its Asscoation with Growth Traits in Jiaxian Red Cattle(Bos taurus)
MA Wei , MA Yun , LIU Dong , GAO Yuan , WANG Ju-Qiang , CHEN Hong. SNPs Detection of Transmembrane Protein 18 Gene (TMEM18) and Its Asscoation with Growth Traits in Jiaxian Red Cattle(Bos taurus)[J]. Journal of Agricultural Biotechnology, 2013, 21(2)
Authors:MA Wei    MA Yun    LIU Dong    GAO Yuan    WANG Ju-Qiang    CHEN Hong
Abstract:
Keywords:
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