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含羞草叶片转录组测序及其黄酮合成途径解析
引用本文:毛仁俊,白朕卿,何志贵,李秋月,吴佳文,陈浩,阎岩. 含羞草叶片转录组测序及其黄酮合成途径解析[J]. 西北农业学报, 2023, 0(4): 611-621
作者姓名:毛仁俊  白朕卿  何志贵  李秋月  吴佳文  陈浩  阎岩
作者单位:(1.延安大学 生命科学学院,陕西省黄土高原资源植物研究与利用省市共建重点实验室,陕西延安 716000; 2.西北农林科技大学 生命科学学院,陕西杨凌 712100)
基金项目:延安大学科研启动项目(YDBK2019-48) ;延安市高层次人才专项(2019-16,2019-23);延安大学大学生创新项目(D2020093)。
摘    要:为了解析含羞草中黄酮类物质的生物合成途径,利用Illumina platform 2000TM测序平台对含羞草叶片进行转录组测序,共获得94 182个Unigene,平均长度为695 bp,N50值为1 159 bp。共有30 243个Unigene注释于50个GO功能组中,其中“代谢过程”“催化活性”以及“细胞”注释的Unigene数量较多。KEGG通路分析鉴定出49个Unigene注释在黄酮生物合成途径,分别编码查尔酮合成酶(CHS,12个Unigene)、查尔酮异构酶(CHI,4)、黄烷酮-3-羟化酶(F3H,3)、黄烷酮-3’-羟化酶(F3’H,9)、黄烷酮-3’,5’-羟化酶(F3’,5’H,1)、二氢黄酮醇4-还原酶(DFR,5)、黄酮醇合成酶(FLS,3)以及无色花色素还原酶(LAR,12)基因。从转录组数据库中鉴定出7 382个以单核苷酸和三核苷酸为主要类型的SSR标记。随机选出10对SSR引物进行扩增,其中有7对能够扩增出清晰的条带。

关 键 词:含羞草   转录组测序   代谢途径   黄酮生物合成

Transcriptome Analysis of Mimosa pudica Linn Leaf and Identification of Flavonoid Biosynthesis Pathway
MAO Renjun,BAI Zhenqing,HE Zhigui,LI Qiuyue,WU Jiawen,CHEN Hao and YAN Yan. Transcriptome Analysis of Mimosa pudica Linn Leaf and Identification of Flavonoid Biosynthesis Pathway[J]. Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica, 2023, 0(4): 611-621
Authors:MAO Renjun  BAI Zhenqing  HE Zhigui  LI Qiuyue  WU Jiawen  CHEN Hao   YAN Yan
Abstract:
Keywords:Mimosa pudica Linn   Transcriptome sequencing   Metabolic pathway   Flavonoid biosynthesis
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