二月兰SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选 |
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引用本文: | 贾新平,孙晓波,梁丽建,苏家乐,邓衍明. 二月兰SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选[J]. 中国农学通报, 2017, 33(5): 40-46 |
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作者姓名: | 贾新平 孙晓波 梁丽建 苏家乐 邓衍明 |
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作者单位: | 江苏省农业科学院园艺研究所 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,江苏省农业科学院园艺研究所 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,江苏省农业科学院园艺研究所 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,江苏省农业科学院园艺研究所 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,江苏省农业科学院园艺研究所 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室 |
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基金项目: | 国家科技支撑项目“重要花卉种质资源发掘与创新利用”(2013BAD01B)。 |
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摘 要: | 为建立适合二月兰的SSR-PCR反应体系,采用正交试验设计方法对影响二月兰SSR反应体系的5个因素(DNA模板、Mg~(2+)、d NTPs、引物和Taq聚合酶)进行优化试验,筛选出每个因素的最佳水平。结果表明,10μL反应体系中,Mg~(2+)浓度2.0 mmol/L,d NTPs浓度0.4 mmol/L,引物浓度0.6μmol/L,DNA模板量20 ng,Taq聚合酶量0.6 U。以3份二月兰基因组DNA为模板,利用优化后的SSR-PCR反应体系进行引物筛选,从50对SSR引物中成功筛选出扩增条带清晰、具有多态性的引物有12对,证明该反应体系具有较好的稳定性和通用性。研究建立和优化的二月兰SSR-PCR反应体系,为进一步利用SSR标记技术开展二月兰分子生物学研究提供了理论依据和技术参考。
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关 键 词: | 二月兰;SSR-PCR;反应体系;引物筛选 |
收稿时间: | 2016-03-17 |
修稿时间: | 2016-12-16 |
Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Selection in Orychophragmus violaceus |
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Abstract: | |
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Keywords: | Orychophragmus violaceus SSR-PCR reaction system primer selection |
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