基于宏基因组测序技术对绵羊呼吸道微生物群落的研究 |
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作者姓名: | 刘海霞 韩大勇 闫 伟 朱爱文 周明夏 王步忠 吴 昊 耿昕之 |
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作者单位: | 刘海霞1,韩大勇1,闫 伟1,朱爱文1,周明夏1,王步忠2,吴 昊3,耿昕之1(1.江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300,2.江苏西来原生态农业有限公司,江苏泰州 225328,3.江苏省阜宁县农业农村局,江苏盐城 224400) |
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基金项目: | 江苏现代农业(肉羊)产业技术体系建设专项资金(JATS[2022]391); |
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摘 要: | 试验采用宏基因组测序技术对4例呼吸道症状发病绵羊(试验组)和4例健康绵羊(对照组)的鼻拭子样本进行高通量测序,分析不同样品间微生物菌群结构功能差异。结果发现,试验组物种注释上,厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门占主导地位;功能注释上,信号传导、氨基酸代谢所含基因数量最多;抗性基因注释上,葡萄球菌和埃希氏杆菌属耐药基因分布最广存在于8个样品中,耐药基因novA、antibiotic、msbA、Mycobacterium、macB广泛存在于除了样品D1以外的其他样品中。发病绵羊呼吸道微生物菌群结构较为复杂,呼吸道菌群结构变化对绵羊机体发病影响显著。
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关 键 词: | 绵羊 宏基因组 病原微生物 高通量测序 群落结构 |
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