陕西秦巴山区野桑蚕线粒体COⅠ序列的遗传多样性与系统进化分析 |
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引用本文: | 孟 刚,彭云武,王瑞娴,等.陕西秦巴山区野桑蚕线粒体COⅠ序列的遗传多样性与系统进化分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2020,48(7):17-26. |
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作者姓名: | 孟 刚 彭云武 王瑞娴 等 |
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作者单位: | 安康学院 陕西省蚕桑重点实验室,安康学院 陕西省蚕桑重点实验室,安康学院 现代农业与生物科技学院 |
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基金项目: | 陕西省教育厅重点实验室科研计划项目(18JS001,18JS002);安康学院高层次人才科研专项(2016AYQDZR02);陕南秦巴山区生物资源综合开发协同创新中心项目(QBXT-Z(Z)-15-5) |
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摘 要: | 【目的】分析野桑蚕(Bombyx mandarina)的遗传多样性,为发掘和利用其基因资源提供参考。【方法】克隆8份秦巴野桑蚕线粒体COⅠ序列,联合GenBank中39份家蚕、17份野桑蚕COⅠ序列,用DnaSP 5.0软件统计核苷酸多样性和单倍型多样性,采用MEGA X软件构建系统发育树,Network 5.0软件构建单倍型中介网络。基于64份COⅠ序列进行聚类分析,分析遗传多样性和单倍型中介网络,探讨家蚕起源。【结果】克隆了8份秦巴野桑蚕线粒体COⅠ及其侧翼序列,序列长1 531 bp,序列间存在18处核苷酸变异,定义了4个单倍型,8份秦巴野桑蚕与沈阳、青州等北方野桑蚕亲缘关系最近。系统发育树将64份线粒体COⅠ序列聚为4个类群,其中中国野桑蚕聚为2个类群,一是来自陕西、辽宁、山东等的北方野桑蚕,与家蚕遗传距离为0.007 21;二是来自江苏、湖北、重庆等的南方野桑蚕,与家蚕遗传距离为0.019 59;日本野桑蚕群体与家蚕遗传距离为0.031 96。64份COⅠ序列共存在84处单碱基变异位点,定义了31种单倍型。单倍型中介网络图显示,31种家蚕、野桑蚕单倍型总体上可分为3个支系,其中单倍型H_22可能为家蚕祖先单倍型。【结论】秦巴山区野桑蚕与北方省份的野桑蚕亲缘关系最近,秦巴山区可能是家蚕驯化的起源地之一。
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关 键 词: | 野桑蚕 遗传多样性 聚类分析 秦巴山区 |
收稿时间: | 2019/7/19 0:00:00 |
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