| 京海黄鸡γ-干扰素水平的全基因组关联分析 |
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| 作者姓名： | 王文浩 张涛 张跟喜 王金玉 李国辉 王永娟 |
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| 作者单位： | 1. 扬州大学动物科学与技术学院, 扬州 225009;2. 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室, 扬州 225009;3. 江苏京海集团, 南通 226103 |
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| 基金项目： | 国家肉鸡产业技术体系(nycytx-42-G1-05);江苏高校优势学科建设工程;江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室 |
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| 摘 要： | 试验旨在寻找影响京海黄鸡γ-干扰素(IFN-γ)水平的分子标记。本研究以京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了血清中INF-γ的浓度,利用简化基因组测序技术进行全基因组关联分析(GWAS),检测与INF-γ浓度相关的SNPs位点。结果共检测到1个在基因组水平上与其潜在显著相关的SNP位点,并达到染色体显著水平。该SNP位于2号染色体上MYOM1基因内部。使用GO数据库对该基因的细胞组分、分子功能和参与的生物进程进行分析,由结果推断MYOM1基因可能为影响京海黄鸡细胞因子INF-γ水平的重要候选基因。
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| 关 键 词： | 简化基因组测序 京海黄鸡 INF-γ 全基因组关联分析 |
| 收稿时间： | 2014-09-03 |
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