盐胁迫下垂穗披碱草叶片转录组差异表达分析 |
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引用本文: | 梁书荣,赵政文.盐胁迫下垂穗披碱草叶片转录组差异表达分析[J].江苏农业科学,2021,49(18):65-71. |
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作者姓名: | 梁书荣 赵政文 |
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作者单位: | 信阳学院,河南信阳464000;中国农业大学草业科学与技术学院草业科学北京市重点实验室,北京 100089 |
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摘 要: | 为探究垂穗披碱草在盐胁迫下的分子响应机制,将200 mmol/L NaCl处理0、6、12、24、36 h的垂穗披碱草叶片进行转录组测序.结果表明,共获得转录本序列数量为462235条,经过注释分析获得单基因序列数量229597条,这些差异基因涉及氨基酸的合成和代谢、淀粉和蔗糖代谢、类黄酮生物合成、碳代谢和植物激素信号传导等途径,可作为研究垂穗披碱草盐胁迫响应主要研究机制.荧光定量PCR(qRT-PCR)验证表明,挑选的7个差异表达基因的表达趋势与测序结果相一致,说明测序结果准确可靠.本研究测序结果为垂穗披碱草的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供了理论参考.
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关 键 词: | 垂穗披碱草 盐胁迫 转录组 基因差异表达 |
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