| 望春玉兰WRKY基因家族生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 戴晓港,刘景胜,李淑娴.望春玉兰WRKY基因家族生物信息学分析[J].江苏林业科技,2021,48(6):1-9. |
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| 作者姓名： | 戴晓港 刘景胜 李淑娴 |
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| 作者单位： | 南京林业大学林学院/南方杨树工程技术研究中心/江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室,江苏 南京 210037 |
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| 摘 要： | WRKY超级转录因子基因家族,参与植物生长、发育、非生物胁迫以及次生代谢产物的调节.该文鉴定了药用植物望春玉兰全基因组WRKY基因,并采用生物信息学方法,分析了该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、保守结构域、顺式作用元件,以及在不同组织中的表达模式.在望春玉兰全基因组中共鉴定56个WRKY基因;根据进化分析的结果,将这些基因分为3个组(GroupⅠ—Ⅲ),又将GroupⅡ进一步分为5个亚组(Ⅱa—Ⅱe).该家族基因蛋白分子量在12215??15—191326??88 Da之间,理论等电点在4??9—10??06之间.亚细胞定位结果显示,55个基因家族成员定位在细胞核,其中1个基因同时定位在细胞外间隙,还有1个基因定位在细胞质.顺式作用元件分析表明,望春玉兰WRKY基因除了广泛参与到调节非生物胁迫中,还参与次生代谢产物的合成调控.该文同时分析了WRKY基因在根、叶片和花中的表达模式,并鉴定了组织特异表达基因.通过对望春玉兰WRKY基因家族的生物信息学分析,为深入研究WRKY基因家族的功能提供了基础.
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| 关 键 词： | 望春玉兰 WRKY转录因子 进化分析 基因表达模式 |
Bioinformatics analysis of WRKY gene family in Yulania biondii |
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| Dai Xiaogang,Liu Jingsheng,Li Shuxian.Bioinformatics analysis of WRKY gene family in Yulania biondii[J].Journal of Jiangsu Forestry Science & Technology,2021,48(6):1-9. |
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| Authors: | Dai Xiaogang Liu Jingsheng Li Shuxian |
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