| 口蹄疫病毒株AF72 VP2的结构模拟与分析 |
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| 引用本文： | 陈启伟,王永录,张永光,潘丽,方玉珍,刘力宽,蒋守田,吕建亮,周鹏,张中旺,张昱,张淑刚,杜进鑫,李正丰,王刚. 口蹄疫病毒株AF72 VP2的结构模拟与分析[J]. 华北农学报, 2009, 24(4) |
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| 作者姓名： | 陈启伟 王永录 张永光 潘丽 方玉珍 刘力宽 蒋守田 吕建亮 周鹏 张中旺 张昱 张淑刚 杜进鑫 李正丰 王刚 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,甘肃,兰州,730046;甘肃农业大学,动物医学院,甘肃,兰州,730070
2. 中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,甘肃,兰州,730046 |
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| 摘 要： | 为了分析FMDV AF72VP2蛋白结构和功能的关系.以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM-Teasy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和SpeⅠ、SphⅠ双酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序.比对测序结果确定AF72 VP2的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72 VP2结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72 VP2结构蛋白的B细胞抗原表位.分析表明,口蹄疫病毒VP1,VP2,VP3 和VP4在核苷酸水平上的变异率是无差异的(P>0.05);而他们在氨基酸水平上的变异率差异显著(P<0.05).该毒株与20株源于GenBank中的VP2氨基酸序列比对发现其保守区主要位于第1～23、37～51、66～76、85～101、124～142、165～199、205～219位.保守区氨基酸残基在维持VP2蛋白的空间构象和功能方面具有重要作用,其中1～10、129～140、165～176氨基酸区段是AF72 VP2结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域,该结果将为进一步的FMDV多表位疫苗研究提供更有价值的参考信息.
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| 关 键 词： | 口蹄疫病毒 VP2结构蛋白 3D结构 B细胞表位 |
Construction and Analysis of VP2 from A Foot-and-mouth Disease Virus Strain AF72 |
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| CHEN Qi-wei,WANG Yong-lu,ZHANG Yong-guang,PAN Li,FANG Yu-zhen,LIU Li-kuan,JIANG Shou-tian,LU Jian-liang,ZHOU Peng,ZHANG Zhong-wang,ZHANG Yu,ZHANG Shu-gang,DU Jin-xin,LI Zheng-feng,WANG Gang. Construction and Analysis of VP2 from A Foot-and-mouth Disease Virus Strain AF72[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2009, 24(4) |
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| Authors: | CHEN Qi-wei WANG Yong-lu ZHANG Yong-guang PAN Li FANG Yu-zhen LIU Li-kuan JIANG Shou-tian LU Jian-liang ZHOU Peng ZHANG Zhong-wang ZHANG Yu ZHANG Shu-gang DU Jin-xin LI Zheng-feng WANG Gang |
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