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黄瓜23对高多态性SSR标记的筛选与评价
引用本文:吕婧,时秋香,任毅,张忠华,黄三文.黄瓜23对高多态性SSR标记的筛选与评价[J].园艺学报,2011,38(11):2140-2146.
作者姓名:吕婧  时秋香  任毅  张忠华  黄三文
作者单位:中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京,100081
基金项目:农业部‘948’项目(2008-Z42); 国家自然科学基金项目(30972011); 国家‘863’计划项目(2010AA10A108)
摘    要: 目前在黄瓜种质研究中仍然缺乏可用的引物。利用黄瓜基因组连锁遗传图谱开发的995对备选SSR引物,挑出在7条染色体上均匀分布且能扩增出清晰稳定单一条带的多态性引物23对,并利用这些引物对黄瓜种质遗传多样性进行了探讨。通过来自不同国家和地区的30份代表性黄瓜种质资源进行SSR扩增分析,从中能够得到153条多态性条带。不同引物分析得到的种质遗传多样性差异较大,供试种质间平均期望杂合度为0.57,平均PIC值(多态性信息量)为0.60。23对引物可以清晰检测出亚洲、欧美和印度群体遗传多样性,较客观地反映了群体结构和地域性差异等信息。

关 键 词:黄瓜  基因组连锁遗传图谱  SSR标记  种质遗传多样性
收稿时间:2011-7-4
修稿时间:2011-8-31

Screening and Evaluation of 23 High Polymorphism SSR Markers in Cucumber
Lü Jing,SHI Qiu-xiang,REN Yi,ZHANG Zhong-hua,HUANG San-wen
.Screening and Evaluation of 23 High Polymorphism SSR Markers in Cucumber[J].Acta Horticulturae Sinica,2011,38(11):2140-2146.
Authors:Lü Jing  SHI Qiu-xiang  REN Yi  ZHANG Zhong-hua  HUANG San-wen
Institution:1. Institutes of Life and Health Engineering, Jinan University, Guangzhou 510632, China; 2. The Fifth Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Zhuhai 519000, China
Abstract:At present,useful primers in the study of cucumber germplasm are scarce,in this study, 23 SSR primers are selected from the 995 primers of cucumber genome linkage map,the 23 SSR primers distribute on the linkage map uniformly and can amplify clear,stable and single bands,using these markers,the genetic diversity of 30 cucumber(Cucumis sativus L.)accessions from different countries or regions was detected,and 153 polymorphism bands were got. Genetic diversity differs among 23 primers. The expected heterozygo...
Keywords:cucumber  genome linkage map  SSR marker  germplasm genetic diversity  
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