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罗非鱼微卫星DNA指纹图谱的构建
引用本文:宋红梅,白俊杰,叶星,全英春,李胜杰.罗非鱼微卫星DNA指纹图谱的构建[J].水产学报,2009,33(3):357-363.
作者姓名:宋红梅  白俊杰  叶星  全英春  李胜杰
作者单位:1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306
2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380
基金项目:国家科技支撑计划(2006BAD01A1201);国家科技基础条件平台工作项目(2005DKA21103);农业部“948”项目(2006-G55)
摘    要:采用微卫星DNA指纹图谱技术对奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼和橙色莫桑比克罗非鱼进行品种鉴定和遗传多样性分析。从103对罗非鱼微卫星引物中筛选出82对多态性高、带型清晰稳定的引物,用这 82对引物检测3种罗非鱼的遗传结构,共检测到605个等位基因,平均等位基因数7.37个,数据经Popgen32计算和EXCEL工具作图,构建3种罗非鱼的DNA指纹数据库,并绘制了DNA指纹图谱模式图。结果显示,奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼和橙色莫桑比克罗非鱼的平均观测杂合度分别为0.179 6、0.530 1和0.312 2,平均期望杂合度分别为0.203 2、0.678 6和0.291 3,平均多态信息含量分别为0.075 4、0.608 3和0.152 8,由此可见,尼罗罗非鱼群体的遗传多样性水平最高,奥利亚罗非鱼群体遗传多样性最低。同时筛选得到16对具特异性条带的核心引物组合可将3种罗非鱼完全区分,每个位点可在其中一种罗非鱼中扩增出独有的条带,从而将这种罗非鱼与其它两种区分开来,将16对特异引物的图谱数据转化成计算机可以识别的数码指纹,可以方便地应用于罗非鱼及其杂交种的鉴定研究。为解决罗非鱼品种混杂遗传渐渗问题和保护罗非鱼种质资源提供技术支撑。

关 键 词:罗非鱼  指纹图谱  微卫星  种质鉴定
收稿时间:4/9/2008 12:00:00 AM
修稿时间:2008/5/28 0:00:00

Establishment of DNA fingerprinting of tilapia with microsatellite
SONG Hongmei,BAI Junjie,YE Xing,QUAN Yingchun and LI Shengjie.Establishment of DNA fingerprinting of tilapia with microsatellite[J].Journal of Fisheries of China,2009,33(3):357-363.
Authors:SONG Hongmei  BAI Junjie  YE Xing  QUAN Yingchun and LI Shengjie
Institution:Pearl River Fisheries Research Institute,,Pearl River Fisheries Research Institute,,
Abstract:Microsatellite DNA fingerprinting technology was used to investigating the genetic variation and germplasm identification within three tilapias of Oreochromis aureus,O.niloticus and red O.mossambicus.82 pairs of primers which could give stable and polymorphic amplification profiles were screened out from 103 microsatellite loci and used to analyze the genetic structure of three varieties.Totally,605 alleles of microsatellite loci were obtained and the average number of alleles was 7.37.Additionally,microsat...
Keywords:tilapia  DNA fingerprinting  microsatellite  germplasm identification  
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