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引用本文: | 李丽莎,李祥龙,周荣艳,李兰会.??????????????1??TYRP1????????????????????[J].贵州农业科学,2016,44(3):113-119. |
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作者姓名: | 李丽莎 李祥龙 周荣艳 李兰会 |
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作者单位: | 1.??????????2.??????????? |
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基金项目: | 河北省高校创新团队领军人才培育计划(LJRC004),河北省应用基础研究计划重点基础研究项目“山羊彩色绒毛关键功能基因及调控元件克隆和功能研究”(15962901D),河北省科技计划项目(15226302D) |
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摘 要: | 为TYRP1基因选择合适的表达系统及该基因编码蛋白的结构和功能的研究提供依据,运用CodonW软件和Usage Codon在线程序分析山羊酪氨酸相关蛋白1基因密码子偏性,比较不同物种TYRP1基因密码子使用偏性,并比较基于同义密码子相对使用度形成的聚类和基于编码区构建的系统发育结果.结果表明:山羊偏好使用的密码子有27个,以A/T结尾密码子的同义密码子相对使用度值明显偏高.山羊与藏羚羊、黑猩猩、家猫、家牛、家犬、家兔、绵羊、双峰驼、羊驼和野猪在密码子使用上相似,与家马不同.基于同义密码子相对使用度的聚类与基于编码区构建的系统发育结果不同,但TYRP1基因编码区形成的亲缘关系更可靠.
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关 键 词: | ??? ???????????1 ??????????? |
Analysis of Codon Bias of TYRP1 Gene in Capra hircus |
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Abstract: | |
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Keywords: | Capra hircus tyrosinase-related protein 1 codon bias |
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