| 从江香猪CYP1A2基因4个外显子的多态性 |
| |
| 引用本文： | 杨家大,任琼,吴声榕.从江香猪CYP1A2基因4个外显子的多态性[J].贵州农业科学,2016(10):84-90. |
| |
| 作者姓名： | 杨家大 任琼 吴声榕 |
| |
| 作者单位： | 1. 凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里,556011;2. 贵州省从江县农业局,贵州从江,557400;3. 凯里学院图书馆,贵州凯里,556011 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目“贵州小型香猪细胞色素氧化酶P450酶系的分子生物学基础研究”(81460572) |
| |
| 摘 要： | 为探明从江香猪细胞色素P450氧化酶CYP1A2基因的标签SNPs,以及积累从江香猪药物代谢酶的基础资料,采用直接测序法对从江香猪CYP1A2基因外显子1、4、5和6进行多态性分析。结果表明:第1外显子存在11个多态位点(g.98G→A、g.147C→G、g.189C→T、g.198C→T、g.211A→G、g.231C→T、g.328T→C、g.338C→A、g.352T→C、g.458G→A和g.778G→A),优势基因型分别为GG、CC、TT、CC、GG、CC、CC、AA、CC、AA和AA,优势等位基因分别为G、C、T、C、G、C、C、A、C、A和A,多态信息含量为0.073 2~0.160 0,有效等位基因数为1.082 3~1.212 7,纯合度为0.827 3~0.920 9,杂合度为0.079 1~0.172 7,香农信息指数为0.166 6~0.318 7,群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。第4外显子存在1个多态位点g.1087C→G,优势基因型为CC,优势等位基因为C,多态信息含量为0.3642,有效等位基因数为1.918 8,纯合度为0.673 8,杂合度为0.326 2,香农信息指数为0.671 8,群体偏离HardyWeinberg平衡(P0.05)。第5、6外显子未发现多态性。从江香猪CYP1A2基因第1外显子多态位点丰富,位点纯合度高、变异性小,具备药物代谢动物模型开发的良好基础,但多态信息含量不足,连锁分析或关联分析时需谨慎选择。第4外显子多态位点少,但位点的多态信息含量合适,可用作连锁分析及关联分析的标签SNP。
|
| 关 键 词： | 从江香猪 CYP1A2 标签SNPs 多态性 |
Polymorphisms of Four Exons in Congjiang Xiang-pig Gene CYP1A2 |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Congjiang Xiang-pig CYP1A2 tag SNP polymorphism |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
