基于COⅠ基因分析7个罗非鱼群体的遗传变异 |
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引用本文: | 姜冰洁,傅建军,朱文彬,王兰梅,方敏,董在杰.基于COⅠ基因分析7个罗非鱼群体的遗传变异[J].上海海洋大学学报,2019,28(6):827-834. |
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作者姓名: | 姜冰洁 傅建军 朱文彬 王兰梅 方敏 董在杰 |
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作者单位: | 南京农业大学 无锡渔业学院, 江苏 无锡 214081,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室, 江苏 无锡 214081,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室, 江苏 无锡 214081,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室, 江苏 无锡 214081,南京农业大学 无锡渔业学院, 江苏 无锡 214081,南京农业大学 无锡渔业学院, 江苏 无锡 214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室, 江苏 无锡 214081 |
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基金项目: | 中国水产科学研究院中央公益事业单位基础研究基金(2017HY-XKQ0203);江苏省自然科学基金(BK20160203) |
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摘 要: | 为了研究罗非鱼群体的遗传多样性及其系统进化关系,以尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、奥利亚罗非鱼(O.aureus)、莫桑比克罗非鱼(O.mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT)和3种红罗非鱼(中国台湾红罗非鱼、马来西亚红罗非鱼、以色列红罗非鱼)7个群体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)的序列进行PCR扩增和序列比对,分析7个罗非鱼群体的遗传变异情况。在324个样品中检测出180个多态性位点和98个单倍型,平均单倍型多样性为0.944,核苷酸多样性为0.036。中性检验Tajima’s D值显示GIFT、莫桑比克罗非鱼和奥利亚罗非鱼群体在经历瓶颈效应和/或纯化选择后种群规模扩大。7个罗非鱼群体间的遗传距离为0.000~0.071,种群遗传分化指数(Fst)值为0.016~0.994。AMOVA分析显示,大多数遗传变异来自群体间(70.78%)。研究还发现,本实验中的奥利亚罗非鱼遗传多样性最低,其余6个群体的遗传多样性较丰富。利用COⅠ基因对7个罗非鱼群体的遗传结构进行分析,丰富了罗非鱼种群特别是红罗非鱼的遗传背景数据,对其种质资源利用具有一定的指导意义。
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关 键 词: | 罗非鱼 COⅠ基因 群体 遗传多样性 |
收稿时间: | 2019/1/9 0:00:00 |
修稿时间: | 2019/5/6 0:00:00 |
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