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滨麦蔗糖:果聚糖6-果糖基转移酶(6-SFT)基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析
引用本文:贺晓岚,王建伟,赵继新,李文旭,武 军,陈新宏. 滨麦蔗糖:果聚糖6-果糖基转移酶(6-SFT)基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析[J]. 麦类作物学报, 2016, 36(5): 549-555. DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2016.05.02
作者姓名:贺晓岚  王建伟  赵继新  李文旭  武 军  陈新宏
作者单位:1. 西北农林科技大学农学院/陕西省植物遗传工程育种重点实验室,陕西杨凌,712100;2. 凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里,556011;3. 河南省农业科学院小麦研究所,河南郑州,450002
基金项目:国家自然科学基金项目(31571650);西北农林科技大学唐仲英育种基金项目
摘    要:为了挖掘和利用滨麦(Leymus mollis,2n=4x=28,JJNN)的优良基因,以拓宽小麦非生物胁迫抗性基因资源,以滨麦为材料,利用RT-PCR结合RACE技术从滨麦叶片中克隆到6-SFT基因cDNA的全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,其cDNA全长为2 086bp,开放阅读框为1 866bp(命名为Lm-6-SFT),编码621个氨基酸;其推导的蛋白分子量为69.1kDa,理论等电点(pI)为5.18,属于酸性蛋白。保守结构域分析表明,该基因推导的氨基酸序列含有SDPDG、RDP和EC结构域。多序列比对及进化树分析表明,滨麦6-SFT与冰草6-SFT在氨基酸水平具有高度的序列相似性。

关 键 词:滨麦  6-SFT基因  克隆  序列分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of cDNA of Sucrose:Fructan-6-Fructosyltransferase (6-SFT) Gene from Leymus mollis
HE Xiaolan,WANG Jianwei,ZHAO Jixin,LI Wenxu,WU Jun,CHEN Xinhong. Cloning and Bioinformatics Analysis of cDNA of Sucrose:Fructan-6-Fructosyltransferase (6-SFT) Gene from Leymus mollis[J]. Journal of Triticeae Crops, 2016, 36(5): 549-555. DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2016.05.02
Authors:HE Xiaolan  WANG Jianwei  ZHAO Jixin  LI Wenxu  WU Jun  CHEN Xinhong
Abstract:
Keywords:Leymus mollis   6-SFT gene   Clone   Sequence analysis
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