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雁鹅ISSR-PCR反应体系的优化*
引用本文:李莹,梁强,赵华宝,王希春,陈亮,骆国胜,钱世荣,章孝荣,吴金节.雁鹅ISSR-PCR反应体系的优化*[J].农业生物技术学报,2009,17(5):939-940.
作者姓名:李莹  梁强  赵华宝  王希春  陈亮  骆国胜  钱世荣  章孝荣  吴金节
作者单位:1. 安徽农业大学动物科技学院,合肥,230036
2. 安徽省郎溪县畜牧兽医局,郎溪,242100
基金项目:安徽省教育厅自然科学重点科研项目 
摘    要:本试验以雁鹅基因组DNA为模板,采用正交试验设计L25(55)对PCR反应中5个因素(引物、dNTPs浓度、模板DNA、Mg2+、TapDNA聚合酶)在5个水平上进行优化实验,在初步实验的基础上通过因素内比较进一步优化各因素在ISSR-PCR反应中的浓度,快速准确地建立雁鹅ISSR-PCR的最佳反应体系,为进一步进行雁鹅遗传多样性的研究、遗传图谱构建和基因定位奠定技术基础。在25uL的反应体系中,确定雁鹅ISSR-PCR的最佳反应体系为:ISSR引物的浓度为0.20umol/L,dNTPs浓度为0.28mmol/L,模板DNA的用量为40ng,Mg2+浓度为1.5 mmol/L,Taq DNA聚合酶的用量为1.0U。在正交试验设计的基础上,通过因素内比较进一步优化各因素在ISSR-PCR反应中的浓度,可以更加准确地确立ISSR-PCR的最佳反应体系。

关 键 词:雁鹅  ISSR-PCR  正交设计  最佳反应体系
收稿时间:2007-9-12
修稿时间:2007-12-3

Optimization of ISSR-PCR Reaction System in Yane geese
Abstract:Using the genomic DNA extracted from Yane geese, the orthogonal design was used to optimize ISSR-PCR amplification system in five levels of five factors(Taq DNA polymerase, Mg2+,DNA template, dNTPs and primer), respectively. Based on the preliminary experiment, the density within factors of ISSR-PCR was further optimized. The purpose of this experiment was to determine the reaction condition of ISSR-PCR fleetly and accurately, which was basis for the study on genetic diversity, map construction and gene localization of Yane geese. The results showed that a better amplification of ISSR was obtained with the reaction system containing 0.20umol/L primer, 0.28mmol/L dNTPs, 40ng templet DNA of Yane geese, 1.5mmol/L Mg2+,1.0U Taq DNA polymerase in the total volume of 25uL. Based on the orthogonal design experiment, the prime reaction condition of ISSR-PCR can be established through the density within factors of ISSR-PCR further optimized.
Keywords:ISSR-PCR
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