| 鸭YAP1基因编码区的克隆、生物信息分析及其组织表达特性 |
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| 引用本文： | 邱佳闵,刘贺贺,王继文. 鸭YAP1基因编码区的克隆、生物信息分析及其组织表达特性[J]. 四川农业大学学报, 2015, 0(1): 71-77,88 |
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| 作者姓名： | 邱佳闵 刘贺贺 王继文 |
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| 作者单位： | 四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室 |
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| 基金项目： | 四川省“十二五”农作物及畜禽育种攻关项目.水禽配套系选育(2011NZ0099-8) |
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| 摘 要： | 【目的】旨在克隆鸭YAP1基因,预测其蛋白结构、功能及其组织表达特性。【方法】以北京肉鸭为材料,采用RT-PCR技术克隆鸭YAP1基因CDS区,利用多种生物信息学分析软件预测其结构与功能,并应用荧光定量PCR检测其组织表达特性。【结果】结果表明:鸭YAP1基因CDS全长1 248bp,编码415个氨基酸,氨基酸水平上与鸡相似性最高,达99.7%;氨基酸序列分析发现鸭YAP1蛋白相对分子量为45 417.5Da,主要定位在细胞核,属水溶性蛋白,不属于分泌蛋白;预测鸭YAP1氨基酸含有磷酸化、糖基化位点各30个;含两个WW结构域,且不同物种间结构域较保守;二级结构以无规则卷曲为主,三级结构呈弯曲状螺旋结构;荧光定量结果显示,YAP1在胰脏中表达量最高,肌肉组织中最低。【结论】鸭YAP1基因非常保守,结构、功能与哺乳动物具较高一致性。
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| 关 键 词： | 鸭 YAP1基因 生物信息学分析 荧光定量PCR |
Molecular Cloning,Bioinformatics of the DuckYAP 1 Gene cDNA Coding Domain Sequence,and Its Differential Expression Profiles in Tissues |
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| QIU Jia-min;LIU He-he;WANG Ji-wen. Molecular Cloning,Bioinformatics of the DuckYAP 1 Gene cDNA Coding Domain Sequence,and Its Differential Expression Profiles in Tissues[J]. Journal of Sichuan Agricultural University, 2015, 0(1): 71-77,88 |
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| Authors: | QIU Jia-min LIU He-he WANG Ji-wen |
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| Affiliation: | QIU Jia-min;LIU He-he;WANG Ji-wen;Institute of Animal Genetics and Breeding,Sichuan Agricultural University; |
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