| 仿刺参3个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析 |
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| 引用本文： | 姬南京,常亚青,高银雪,赵冲,宋坚. 仿刺参3个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 0(5) |
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| 作者姓名： | 姬南京 常亚青 高银雪 赵冲 宋坚 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁 大连,116023 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，国家“863”计划项目 |
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| 摘 要： | 利用核糖体DNA第一内转录间隔区(Internal transcribed spacer 1, ITS1)序列,对中国大连(CD)、朝鲜罗津( KN)和俄罗斯海参崴( RV)仿刺参Apostichopus japonicus 3个群体的遗传结构进行分析。结果表明：经PCR扩增、克隆测序,获得长度为517~519 bp、524 bp两种类型的ITS1核苷酸序列,平均G+C含量(64.5%)显著高于A+T含量(35.5%)；在仿刺参30个个体61条序列中共检测到49个变异位点,多态位点比例为9.33%,其中有4个简约信息位点,共有40种基因型,群体共享基因型为2个；遗传多样性分析表明,3个群体的遗传多样性丰富；分子方差分析显示,88.65%的变异来自于群体内部,群体间遗传分化较弱或中度分化；根据群体间遗传距离进行的聚类分析发现, KN群体与RV群体的亲缘关系较近, CD群体与KN、 RV群体的亲缘关系较远。
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| 关 键 词： | 仿刺参 ITS1序列 遗传多样性 遗传分化 |
Variation in ITS1 sequences and phylogenetic analysis of three geographical stocks of sea cucumber Apostichopus japonicus |
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| JI Nan-jing,CHANG Ya-qing,GAO Yin-xue,ZHAO Chong,SONG Jian. Variation in ITS1 sequences and phylogenetic analysis of three geographical stocks of sea cucumber Apostichopus japonicus[J]. Journal of Dalian Fisheries University, 2014, 0(5) |
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| Authors: | JI Nan-jing CHANG Ya-qing GAO Yin-xue ZHAO Chong SONG Jian |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Apostichopus japonicus ITS1 sequences genetic diversity genetic differentiation |
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