巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的克隆和分析 |
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作者姓名: | 尚常花 朱顺妮 袁振宏 王忠铭 |
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作者单位: | 中国科学院广州能源研究所、中国科学院可再生能源与天然气水合物重点实验室,广东广州510640 |
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基金项目: | Supported by Comprehensive Strategic Cooperation Project betweenGuangdong Province and Chinese Academy of Sciences (2010A0-90100010); National Key Technology R&D Program of the 12thFive-year Plan of China (2011BAD14B03); Foundation of KeyLaboratory of Renewable Energy and Natural Gas Hydrate ChineseAcademy of Sciences (y107j6)广东省中国科学院全面战略合作项目(2010A090100010);科技部十二五支撑计划(2011BADl4803);中国科学院可再生能源与天然气水合物重点实验室基金(y107j6). |
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摘 要: | [目的]获得巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。[方法]以巴夫杜氏藻cDNA为模板,采用简并引物进行PCR扩增,获得533 bp特异cDNA片段。在此基础上,设计特异引物,采用5′-GenomeWalking和3′-RACE的方法,获得基因的5′-端DNA序列和3′-端cDNA序列,进而获得β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。[结果]获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的特异cDNA片段、5′-端DNA和3′-端cDNA片段。经拼接后,扩增出全长cDNA。β-肌动蛋白基因cDNA全长1 754 bp,包括1 137 bp的开放读码框和617 bp的3′-非翻译区序列。氨基酸序列相似性分析发现,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白氨基酸序列与杜氏盐藻、莱茵衣藻等的同源性较高。系统发育分析表明,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白与杜氏盐藻的相似性最高。[结论]首次获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列并发现巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因非常保守。
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关 键 词: | 巴夫杜氏藻 β-肌动蛋白基因 克隆 |
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