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巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的克隆和分析
引用本文:尚常花,朱顺妮,袁振宏,王忠铭.巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的克隆和分析[J].农业科学与技术,2011(7):971-974.
作者姓名:尚常花  朱顺妮  袁振宏  王忠铭
作者单位:中国科学院广州能源研究所、中国科学院可再生能源与天然气水合物重点实验室,广东广州510640
基金项目:Supported by Comprehensive Strategic Cooperation Project betweenGuangdong Province and Chinese Academy of Sciences (2010A0-90100010); National Key Technology R&D Program of the 12thFive-year Plan of China (2011BAD14B03); Foundation of KeyLaboratory of Renewable Energy and Natural Gas Hydrate ChineseAcademy of Sciences (y107j6)广东省中国科学院全面战略合作项目(2010A090100010);科技部十二五支撑计划(2011BADl4803);中国科学院可再生能源与天然气水合物重点实验室基金(y107j6).
摘    要:目的]获得巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。方法]以巴夫杜氏藻cDNA为模板,采用简并引物进行PCR扩增,获得533 bp特异cDNA片段。在此基础上,设计特异引物,采用5′-GenomeWalking和3′-RACE的方法,获得基因的5′-端DNA序列和3′-端cDNA序列,进而获得β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。结果]获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的特异cDNA片段、5′-端DNA和3′-端cDNA片段。经拼接后,扩增出全长cDNA。β-肌动蛋白基因cDNA全长1 754 bp,包括1 137 bp的开放读码框和617 bp的3′-非翻译区序列。氨基酸序列相似性分析发现,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白氨基酸序列与杜氏盐藻、莱茵衣藻等的同源性较高。系统发育分析表明,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白与杜氏盐藻的相似性最高。结论]首次获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列并发现巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因非常保守。

关 键 词:巴夫杜氏藻  β-肌动蛋白基因  克隆
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