玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因的生物信息学分析 |
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引用本文: | 孙培元,王俊强,韩业辉,于运凯,许健,周超,李昕. 玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因的生物信息学分析[J]. 黑龙江农业科学, 2016, 0(3): 7-12. DOI: 10.11942/j.issn1002-2767.2016.03.0007 |
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作者姓名: | 孙培元 王俊强 韩业辉 于运凯 许健 周超 李昕 |
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作者单位: | 1. 黑龙江省农业科学院齐齐哈尔分院,黑龙江齐齐哈尔,161041;2. 黑龙江省农业科学院五常水稻研究所,黑龙江五常,150229 |
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摘 要: | 为了研究玉米RNA结合蛋白在玉米生长发育中的调节机制,以一个玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因为材料,采用生物信息学的方法,对其理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、功能域、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:基因包含一个1 335bp开放阅读框,是一种具有亲水能力的不稳定酸性蛋白,相对分子质量38.301 1kDa,包含两个RRM超亲家族(RRM superfamily),无信号肽序列,无跨膜结构域,亚细胞定位在细胞质上,二级结构由无规则卷曲、α螺旋、延伸链和β折叠构成;系统进化树分析表明,GRMZM2G052926蛋白与水稻Os05g0437300蛋白亲缘关系最近,同源性达到87%。
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关 键 词: | 玉米 RNA结合蛋白 GRMZM2G052926基因 生物信息学 |
Bioinformatics Analysis of the RNA-binding Protein GRMZM2G052926 Gene in Maize |
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Abstract: | |
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