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甘草幼苗响应干旱胁迫的光合、抗氧化特性及转录组分析
引用本文:关思静,王楠,徐蓉蓉,葛甜甜,高静,彭亮,张岗,陈莹. 甘草幼苗响应干旱胁迫的光合、抗氧化特性及转录组分析[J]. 草业科学, 2022, 1(1): 2176-2190. DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2020-0647
作者姓名:关思静  王楠  徐蓉蓉  葛甜甜  高静  彭亮  张岗  陈莹
作者单位:陕西中医药大学药学院,/,陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心,,陕西,咸阳,712046;陕西中医药大学,/,陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心,,陕西,咸阳,712083
基金项目:根际真菌提高甘草水分和磷利用率的生理机制研究(31600320)%甘草高产优质品种选育及其配套栽培技术研究(2018SF-338)%陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发学科创新团队项目(2019-QN01)
摘    要:为探究乌拉尔甘草(Glycyrrhiza uralensis)对干旱胁迫的生理及分子响应机制,本研究采用聚乙二醇6000 (polyethylene glycol 6000, PEG-6000)模拟干旱的方法,测定乌拉尔甘草幼苗光合指标和抗氧化酶活性,并进行转录组测序分析。结果表明:干旱胁迫至7 d时,甘草的净光合速率(net photosynthetic rate, Pn)、气孔导度(stomatal conductance, Gs)、蒸腾速率(transpiration rate, Tr)到达最低值。相对叶绿素含量(soil and plant analyzer develotrnent, SPAD)表现为先上升后下降。干旱引起甘草的氧化应激,处理1 d时提高了叶片中过氧化氢酶(catalase, CAT)活性,降低了根中CAT活性。处理7 d时提高了根中过氧化物酶(peroxide, POD)活性,降低了根中超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)活性。转录组分析结果显示,甘草地上部分和地下部分分别有差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs) 7 500和5 298个;基因本体(gene ontology, GO)富集结果表明,地上和地下两部分的DEGs在三大类的分布基本一致,均被显著富集到细胞过程、代谢过程、细胞结构、催化活性、转导活性等功能;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)代谢途径富集分析表明,地上部分和地下部分DEGs均显著富集在转录因子、蛋白激酶、苯丙烷类生物合成和细胞色素P450等代谢途径。转录调控网络分析预测表明,ERF (ethylene responsive factor)、bHLH (basic helix-loop-helix)、NAC (NAM/ATAF/CUC)、MYB (v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)和WRKY 类转录因子可能与甘草次级代谢产物相关基因存在转录调控关系。综上,本研究揭示了干旱胁迫对甘草生理特性的影响,分析了不同部位基因的表达,可为今后研究甘草抗旱机制提供有价值的信息。

关 键 词:药用植物  胁迫  生理特性  超氧化物歧化酶  过氧化物酶  富集分析  调控网络

Photosynthesis,antioxidant enzyme activity,and transcriptome sequencing analyses of Glycyrrhiza uralensis seedlings in response to drought stress
GUAN Sijing,WANG Nan,XU Rongrong,GE Tiantian,GAO Jing,PENG Liang,ZHANG Gang,CHEN Ying. Photosynthesis,antioxidant enzyme activity,and transcriptome sequencing analyses of Glycyrrhiza uralensis seedlings in response to drought stress[J]. Pratacultural Science, 2022, 1(1): 2176-2190. DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2020-0647
Authors:GUAN Sijing  WANG Nan  XU Rongrong  GE Tiantian  GAO Jing  PENG Liang  ZHANG Gang  CHEN Ying
Abstract:
Keywords:medicinal plant  stress  physiological characteristics  superoxide dismutase  peroxidase  enrichment analysis  regulatory network
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