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猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究
引用本文:郑亚洲,王国平,周菊芳,朱晨熹,王利平,徐文兴,洪霓.猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究[J].园艺学报,2015,42(4):665-671.
作者姓名:郑亚洲  王国平  周菊芳  朱晨熹  王利平  徐文兴  洪霓
作者单位:1华中农业大学植物科技学院,湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室,武汉 430070;2农业微生物学国家重点实验室,武汉 430070
基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项项目(nyhyzx200903017-08)
摘    要:为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,AcVA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,AcVB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的AcVA和AcVB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集的6种猕猴桃样品中均检测到一种或两种病毒。发现AcVA的ORF1、ORF4和ORF5扩增片段序列存在较大分子变异,不同分离物的269 bp片段(ORF1)核苷酸序列相似性为77.3% ~ 99.3%。在基于各扩增片段核苷酸序列的系统进化树中,AcVA分离物聚为2 ~ 3组。采用引物AcVB5F/5R扩增获得20个AcVB分离物的342 bp或338 bp的ORF5片段,核苷酸序列相似性为81% ~ 100%,与新西兰AcVB分离物TP7-93B相应片段的核苷酸序列相似性为83.9% ~ 99.7%,在系统进化树中聚为3组。

关 键 词:猕猴桃  猕猴桃病毒A  猕猴桃病毒B  RT-PCR  序列分析  

The Detection of Actinidia virus A and Actinidia virus B by RT-PCR and Their Molecular Variation Analysis
ZHENG Ya-zhou;WANG Guo-ping;ZHOU Ju-fang;ZHU Chen-xi;WANG Li-ping;XU Wen-xing;HONG Ni.The Detection of Actinidia virus A and Actinidia virus B by RT-PCR and Their Molecular Variation Analysis[J].Acta Horticulturae Sinica,2015,42(4):665-671.
Authors:ZHENG Ya-zhou;WANG Guo-ping;ZHOU Ju-fang;ZHU Chen-xi;WANG Li-ping;XU Wen-xing;HONG Ni
Institution:1.College of Plant Science and Technology,Key Lab of Crop Disease Monitoring and Safety Control in Hubei,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China;2National Key Lab of Agromicrobiology,Wuhan 430070,China
Abstract:
Keywords:Actinidia  Actinidia virus A  Actinidia virus B  RT-PCR  sequence analysis
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