基于转录组测序对剑白香猪黑色素生成相关基因的筛选与分析

毛色作为猪的品种特征，有着重要的研究意义。本研究为筛选剑白香猪黑色素生成相关基因，通过转录组测序技术对贵州剑白香猪黑色被毛皮肤和白色被毛皮肤进行转录组测序，并运用qRT-PCR和免疫组化技术验证测序结果。结果识别差异表达基因1 230个，其中相较于白色被毛皮肤组织而言，黑色被毛皮肤组织中上调基因有738个，下调基因有492个，包括与黑色素合成相关基因，如酪氨酸酶基因(tyrosinase, TYR)、酪氨酸相关蛋白1基因(tyrosinase-related protein1,TYRP1)、多巴色素异构酶(dopachrometautomerase, DCT)、黑色素A基因(melan-A,MLANA)等，且这些基因在剑白香猪黑色被毛皮肤中的表达量显著高于白色被毛皮肤。基因本体(gene ontology, GO)分析发现共有1 070个差异表达基因显著富集于9个GO term,包括蛋白降解(proteolysis)、生物调节(regulation of biological quality)、细胞连接复合体(extracellular matrix organization)、细胞质...