巨桉纤维素合酶Ces家族的生物信息学分析 |
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作者姓名: | 徐双 曾炳山 范春节 刘英 李湘阳 裘珍飞 |
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作者单位: | 中国林业科学研究院,中国林业科学研究院,中国林业科学研究院,中国林业科学研究院,中国林业科学研究院,中国林业科学研究院 |
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基金项目: | 国家“863”项目“桉树与鹅掌楸转基因育种技术研究”(2013AA100705) |
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摘 要: | 纤维素合酶(Cellulose synthase,Ces)基因家族成员负责催化纤维素的合成。利用Phytozome网站对巨桉(Eucalyptus grandis)全基因组序列进行检索,共发现31条蛋白质序列属于Ces家族,其中包括18个CesA亚族成员与13个CslD亚族成员。使用ClustalW、Protparam、TMHMM等生物学在线服务器,对巨桉31个Ces家族成员进行全面生物信息学分析预测,结果显示:31条蛋白质序列均具有Cellulose synthase特征性保守结构域,具有Ces家族成员特征;巨桉Ces家族与拟南芥Ces家族、杨树Ces家族在亚族种类、成员组成、蛋白理化性质方面存在变异性;蛋白结构域、二级结构、跨膜区预测、无序性、亚细胞定位分析结果存在保守性。
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关 键 词: | 巨桉 纤维素合酶家族 生物信息学分析 |
收稿时间: | 2014-03-13 |
修稿时间: | 2014-03-26 |
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