猕猴桃DNA条形码标记的筛选 |
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引用本文: | 叶婵娟,杨妙贤,刘文,梁红.猕猴桃DNA条形码标记的筛选[J].北方园艺,2015(24):79-83. |
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作者姓名: | 叶婵娟 杨妙贤 刘文 梁红 |
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作者单位: | 仲恺农业工程学院生命科学学院,广东广州,510225;仲恺农业工程学院生命科学学院,广东广州510225;华南农业大学农学院,广东广州510642 |
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基金项目: | 广东省科技计划资助项目,广东省教育厅科技攻关重点项目 |
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摘 要: | 以5种野生猕猴桃为试验材料,采用DNA条形码技术,对6个DNA条形码标记rbcL、matK、psbA、trnL-F、ITS、trnH-psbA进行序列分析,筛选出能鉴别猕猴桃种间分子差异的DNA条形码,以期利用DNA条形码技术用于猕猴桃育种。结果表明:通过序列碱基含量分析,trnL-F和ITS条形码序列的GC含量最高,为51.1%~55.2%,trnH-psbA的GC含量最小,约为32.0%;通过Blast比对,结果显示5个猕猴桃野生种与基因库中已登录种类的6个DNA条形码相似度在99%以上,而有些与基因库中已登录种类有所差异,体现出猕猴桃种内的遗传多样性或种间存在基因渗透;从系统进化树结果分析显示,ITS标记能将上述5个野生种明显区分,基因进化多样性两两比对分析显示,5个猕猴桃野生种之间差异明显;Tajima’s中性检验中,trnL-F,ITS和matK具有较高的核苷酸多样性和中性检验值。研究比较了6种DNA条形码标记,认为ITS种间多样性较高,差异明显,较适宜作为猕猴桃DNA条形码。
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关 键 词: | 猕猴桃 野生种 DNA条形码 筛选 |
Screening of DNA Barcode for Actinidia |
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Abstract: | |
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