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| 新型鹅细小病毒四川株的全基因组扩增及遗传进化分析 | |
| 作者单位： | ;1.西南民族大学生命科学与技术学院;2.四川农业大学动物医学院预防兽医研究所;3.四川农业大学动物医学院禽病防治与研究中心;4.四川农业大学动物医学院动物疾病与人类健康四川省重点实验室 |
| 摘 要： | 【目的】了解四川地区新型鹅细小病毒(Novel goose parvovirus,NGPV)的分子生物学特征及遗传变异情况。【方法】根据Gen Bank中发表的新型鹅细小病毒的全基因组序列,设计5对兼并引物采用PCR方法分段扩增新型鹅细小病毒四川株的全基因组序列,并利用DNAstar等生物信息分析软件对获得的基因组序列进行分子特性与遗传演变分析。【结果】获得的新型鹅细小病毒四川株(命名为SC16)全长5 109 nt,5′端ITR长408 nt,3′端ITR长407 nt,NS基因长1 884 nt,VP基因长2 199 nt。序列比对和遗传进化分析显示,SC16株与山东分离株SDLC01(KT343253.1)及QH15(KT751090.1)的基因组核苷酸同源性高达99%,与两者的亲缘关系最近,基于NS及VP蛋白的氨基酸序列系统进化树分析结果与此一致。但SC16株的5′端ITR还是发生了一定的变异:与SDLC01及QH15相比,多了几个14 nt的插入片段。【结论】研究结果丰富了NGPV的分子生物学资料。 |
| 关 键 词： | 新型鹅细小病毒 鸭短喙侏儒综合征 全基因组扩增 遗传进化分析 |
Amplification and Phylogenetic Analysis of Novel Goose Parvovirus Sichuan Strain |
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