薄壳山核桃(Carya illinoinensis)叶绿体基因组及其特征分析 |
| |
引用本文: | 蒋思思,袁军,周文君,钮根花,周俊琴.薄壳山核桃(Carya illinoinensis)叶绿体基因组及其特征分析[J].园艺学报,2022(8):1772-1784. |
| |
作者姓名: | 蒋思思 袁军 周文君 钮根花 周俊琴 |
| |
作者单位: | 1. 中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室;2. 德州农工大学农业生命研究中心 |
| |
基金项目: | 湖南省重点研发项目(2018WK2041); |
| |
摘 要: | 利用Illumina平台对薄壳山核桃(Caryaillinoinensis)品种‘金华’‘波尼’和1株实生古树单株的叶绿体全基因组进行测序,并对其特征进行分析。3个薄壳山核桃叶绿体基因组均呈典型的四分体结构,大小分别为160 819、162 611和160 762 bp,基因序列高度保守。三者均注释得到124个基因,包括79种蛋白编码基因、38个tRNA和7个r RNA基因;三者有相似的重复序列类型,在其叶绿体基因组序列中分别检测出74、74和73个SSR位点;系统发育分析表明,三者均与喙核桃(Annamocarya sinensis)亲缘关系最为密切。
|
关 键 词: | 山核桃 叶绿体基因组 简单重复序列 系统发育关系 |
|
|