甘肃省苹果坏死花叶病毒检测及遗传多样性分析 |
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引用本文: | 李世帆,邵宇纯,祁豪男,杨兰,李小伟,徐秉良,陈雅寒.甘肃省苹果坏死花叶病毒检测及遗传多样性分析[J].园艺学报,2022(11):2431-2438. |
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作者姓名: | 李世帆 邵宇纯 祁豪男 杨兰 李小伟 徐秉良 陈雅寒 |
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作者单位: | 甘肃农业大学植物保护学院 |
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基金项目: | 甘肃省自然科学基金项目(21JR7RA820); |
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摘 要: | 为明确甘肃省苹果坏死花叶病毒(apple necrotic mosaic virus,Ap NMV)的发生及遗传变异情况,采用反转录PCR方法对采自甘肃7个地区表现花叶症状和无明显症状的共93份苹果叶片样品进行了检测。结果显示Ap NMV的平均检出率为66.67%,说明其在甘肃省苹果产区普遍发生。对其中9份样品中Ap NMV的外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行了克隆和测序,其分离物CP的核苷酸和编码蛋白氨基酸序列相似性分别为92.3%~99.7%和93.6%~99.1%,与NCBI数据库中来自中国、印度、日本等国家的18个Ap NMV分离物核苷酸和氨基酸序列相似性分别为86.7%~99.7%和87.1%~99.7%。基于CP基因全长序列构建的系统发育树,Ap NMV分离物聚集成5个组,9个Ap NMV甘肃分离物与其他Ap NMV分离物分别聚集形成组Ⅰ、组Ⅱ和组Ⅴ。9条Ap NMV全长CP基因序列中检测到1个潜在重组事件。
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关 键 词: | 苹果 ApNMV CP RT-PCR 遗传多样性 重组 |
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