| 猪流行性腹泻病毒ORF3基因的克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 易华山,毕俊萱,马鲜平,唐明霞,张德志,王芝英.猪流行性腹泻病毒ORF3基因的克隆及序列分析[J].西北农业学报,2017,26(7):968-974. |
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| 作者姓名： | 易华山 毕俊萱 马鲜平 唐明霞 张德志 王芝英 |
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| 作者单位： | (西南大学 荣昌校区动物医学系，重庆 402460) |
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| 基金项目： | 西南大学荣昌校区青年科学基金（RC20700925＆RC20700421）；中央高校基本业务费专项基金（XDJK2015C032）。 |
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| 摘 要： | 为研究2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场是否有猪流行性腹泻病毒的感染与流行,对猪流行性腹泻病毒ORF3(Open reading flame 3)基因进行克隆及序列分析研究。通过从疑似流行性腹泻病毒感染的猪场采集小肠组织,采用RT-PCR方法对猪流行性腹泻病毒的ORF3基因进行克隆。结果表明,所获得的ORF3基因ORF长675bp,编码223个氨基酸。通过DNAMAN软件分析,表明本研究中克隆的ORF3基因与CV777标准株(AF353511)的ORF3基因相似性为96.45%,与中国的NJ(KJ642645)的相似性最高,为99.41%,与attenuated DR13疫苗株(EU054930)相似性90.52%,而与CV777疫苗株(GU372744)相似性仅79.07%。系统进化树分析表明,该基因与中国毒株、韩国毒株以及美国分离株USA/Illinois 201/2014(KR265795)处于同一进化分支上,而attenuated DR13疫苗株、CV777 truncated疫苗株和欧洲的CV777标准株处于另一个进化分支上,说明该基因与中国毒株、韩国毒株的遗传距离最近。通过B细胞抗原表位预测分析,发现其氨基酸第65~68、114~116、137~140和150~154区域可能有潜在的优势抗原表位。成功克隆了猪流行性腹泻病毒ORF3基因,说明2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场存在猪流行性腹泻病毒的感染。
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 ORF3基因 序列分析 |
Cloning and Sequence Analysis of Porcine Epidemic Diarrhea Virus ORF3 Gene |
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| YI Huashan,BI Junxuan,MA Xianping,TANG Minxi,ZHANG Dezhi and WANG Zhiying.Cloning and Sequence Analysis of Porcine Epidemic Diarrhea Virus ORF3 Gene[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2017,26(7):968-974. |
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| Authors: | YI Huashan BI Junxuan MA Xianping TANG Minxi ZHANG Dezhi and WANG Zhiying |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Porcine epidemic diarrhea virus ORF3 gene Sequence analysis |
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