| 羊口疮病毒重庆株F1L基因克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李鹏飞,冯 将,刘 嫒,包细明,张 益,李 婷,鲜思美.羊口疮病毒重庆株F1L基因克隆与生物信息学分析[J].西北农业学报,2017,26(9):1281-1288. |
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| 作者姓名： | 李鹏飞 冯 将 刘 嫒 包细明 张 益 李 婷 鲜思美 |
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| 作者单位： | （1.贵州大学 动物科学学院，贵阳 550025；2.贵州省动物疫病研究所，贵阳 550025） |
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| 基金项目： | 贵州省科学技术基金［LH(2014)7667］；贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队［(2015) 4016］。 |
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| 摘 要： | 旨在分析OrfV-CQ株F1L基因的分子特点,预测其编码蛋白的生物学功能。对OrfV-CQ株F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,利用生物信息学相关软件进行序列分析并对其编码蛋白的二级结构、B细胞表位、T细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽进行预测。结果表明,OrfV-CQ株F1L基因长1 023bp,编码340个氨基酸,与Shanxi株F1L基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%和95.0%。OrfV-CQ株F1L基因编码蛋白的α-螺旋、β-片层、β-转角、无规则卷曲分别为11.21%、10.3%、2.73%、75.76%;可能存在5个B细胞优势抗原表位,3个CTL表位,4个Th细胞表位,无跨膜结构域和信号肽。
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| 关 键 词： | 羊口疮病毒 F1L基因 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of F1L Gene in Chongqing Orf Virus |
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| LI Pengfei,FENG Jiang,LIU Ai,BAO Ximing,ZHANG Yi,LI Ting and XIAN Simei.Cloning and Bioinformatic Analysis of F1L Gene in Chongqing Orf Virus[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2017,26(9):1281-1288. |
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| Authors: | LI Pengfei FENG Jiang LIU Ai BAO Ximing ZHANG Yi LI Ting and XIAN Simei |
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