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线辣椒SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选
引用本文:李全辉,李 江,邵登魁,王亚艺,侯全刚,钟启文.线辣椒SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选[J].西北农业学报,2017,26(7):1047-1053.
作者姓名:李全辉  李 江  邵登魁  王亚艺  侯全刚  钟启文
作者单位:(青海大学 农林科学院,西宁 810016)
基金项目:青海省农林科学院中青年基金(2014-NKY-04);青海省遗传与生理重点实验室项目。
摘    要:以循化线辣椒果实黄色突变体H0809和高代自交系0599-1为试材,采用L_9(3~4)正交试验设计,研究线辣椒SSR-PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响,并对420对SSR分子标记进行筛选。结果表明,最优的反应体系为:总体积20μL,基因组DNA 20 ng,dNTP 100μmol·L~(-1),引物0.6μmol·L~(-1),Mg~(2+)2.5 mmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶1.5μmol;通过筛选,获得72对具有多态性的SSR标记,多态性率为17.1%,平均每个标记扩增出2.67个等位基因。本试验建立的SSR-PCR反应体系和筛选的多态性标记可用于线辣椒种质资源分析、分子标记辅助育种、分子遗传图谱构建及基因克隆等研究。

关 键 词:线辣椒  SSR  体系优化  引物筛选

Optimization of SSR-PCR Reaction System and Selection for Polymorphic Primers in Chili Pepper(Capsicum annuum var.longunt)
LI Quanhui,LI Jiang,SHAO Dengkui,WANG Yayi,HOU Quangang and ZHONG Qiwen.Optimization of SSR-PCR Reaction System and Selection for Polymorphic Primers in Chili Pepper(Capsicum annuum var.longunt)[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2017,26(7):1047-1053.
Authors:LI Quanhui  LI Jiang  SHAO Dengkui  WANG Yayi  HOU Quangang and ZHONG Qiwen
Abstract:
Keywords:Capsicum annuum var  longunt  SSR  System optimization  Primer screening
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